30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3412 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3412  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  811    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4972  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  68.34 
 
 
398 aa  578  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11556  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0537  endonuclease/exonuclease/phosphatase  58.76 
 
 
391 aa  434  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1964  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  53.92 
 
 
394 aa  416  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.728612  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02779  putative orphan protein  51.62 
 
 
404 aa  402  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.313738  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1530  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.87 
 
 
672 aa  337  2.9999999999999997e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  47.7 
 
 
1844 aa  326  5e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15310  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  44.07 
 
 
396 aa  325  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.741887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.2 
 
 
1016 aa  319  5e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0922  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.5 
 
 
424 aa  309  4e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04860  phytase  45.85 
 
 
410 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06470  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  45.08 
 
 
411 aa  300  2e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1073  protein of unknown function DUF1555  40.6 
 
 
457 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1108  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.63 
 
 
401 aa  299  6e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2941  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.53 
 
 
396 aa  299  6e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1102  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.6 
 
 
457 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.530599  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0220  PKD domain containing protein  50.3 
 
 
705 aa  297  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0937242  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5254  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.75 
 
 
447 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.668136 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3484  hypothetical protein  37.33 
 
 
464 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0729061 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3003  hypothetical protein  40.58 
 
 
472 aa  249  8e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697597  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000275  succinyl-CoA synthetase alpha subunit  35.73 
 
 
454 aa  243  5e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3335  hypothetical protein  36.16 
 
 
463 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000697045  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05881  phytase  36.32 
 
 
454 aa  239  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2523  hypothetical protein  31.84 
 
 
350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3763  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.58 
 
 
341 aa  159  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0125  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.01 
 
 
279 aa  151  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0082  hypothetical protein  29.15 
 
 
374 aa  143  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431101  normal  0.216389 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0860  hypothetical protein  30.17 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2519  hypothetical protein  30.17 
 
 
309 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6804  phytase  50.91 
 
 
98 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.768619  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>