45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1530 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1530  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
672 aa  1328    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15310  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  66.67 
 
 
396 aa  498  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.741887 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  62.37 
 
 
1844 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  63.75 
 
 
1016 aa  458  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06470  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  59.3 
 
 
411 aa  433  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0922  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  60.85 
 
 
424 aa  432  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2941  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  56.76 
 
 
396 aa  403  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0220  PKD domain containing protein  56.73 
 
 
705 aa  367  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0937242  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1102  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.42 
 
 
457 aa  362  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.530599  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1073  protein of unknown function DUF1555  47.42 
 
 
457 aa  361  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3412  hypothetical protein  49.87 
 
 
394 aa  336  9e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0537  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.96 
 
 
391 aa  335  1e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04860  phytase  48.41 
 
 
410 aa  334  3e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5254  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.45 
 
 
447 aa  334  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.668136 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1108  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.21 
 
 
401 aa  326  7e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4972  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.11 
 
 
398 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11556  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3533  hypothetical protein  62.55 
 
 
323 aa  314  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.822199  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1964  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  44.68 
 
 
394 aa  310  5e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.728612  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02779  putative orphan protein  48.2 
 
 
404 aa  307  3e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.313738  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2129  secreted protein  59.26 
 
 
288 aa  281  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.330008 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4257  secreted protein  59.27 
 
 
311 aa  263  6.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.256358 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05881  phytase  37.04 
 
 
454 aa  239  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2523  hypothetical protein  40.54 
 
 
350 aa  232  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3003  hypothetical protein  37.1 
 
 
472 aa  230  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697597  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000275  succinyl-CoA synthetase alpha subunit  34.72 
 
 
454 aa  229  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3484  hypothetical protein  36.74 
 
 
464 aa  229  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0729061 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3335  hypothetical protein  36.01 
 
 
463 aa  227  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000697045  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0082  hypothetical protein  40.32 
 
 
374 aa  225  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431101  normal  0.216389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3513  hypothetical protein  46.5 
 
 
646 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22760  hypothetical protein  47.77 
 
 
296 aa  197  7e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.488821  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6675  hypothetical protein  39.84 
 
 
277 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0125  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.5 
 
 
279 aa  173  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3763  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.15 
 
 
341 aa  160  9e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0860  hypothetical protein  36.34 
 
 
309 aa  156  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2519  hypothetical protein  35.64 
 
 
309 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4822  alkaline phosphatase  37.08 
 
 
261 aa  154  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6804  phytase  75 
 
 
98 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.768619  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1383  Alkaline phosphatase  35.39 
 
 
608 aa  137  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3249  alkaline phosphatase  28.93 
 
 
607 aa  124  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.565022  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1372  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.35 
 
 
252 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0780489  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0006  Alkaline phosphatase  30.71 
 
 
610 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.50499  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02145  hypothetical protein  30.99 
 
 
493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.935466 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08808  hypothetical protein  32.71 
 
 
335 aa  107  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80898  predicted protein  25.68 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.201382  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06120  expressed protein  27.4 
 
 
455 aa  75.5  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0135237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>