30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1108 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1108  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 401 aa  824    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04860  phytase  74.47 
 
 		 410 aa  586  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15310  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  46.73 
 
 		 396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.741887 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06470  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  46.08 
 
 		 411 aa  328  7e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1530  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.21 
 
 		 672 aa  328  2.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0922  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.64 
 
 		 424 aa  315  8e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  44.65 
 
 		 1844 aa  306  6e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3412  hypothetical protein  41.63 
 
 		 394 aa  299  6e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1102  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.3 
 
 		 457 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.530599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1073  protein of unknown function DUF1555  40.3 
 
 		 457 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1964  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  40.76 
 
 		 394 aa  294  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.728612  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4972  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.04 
 
 		 398 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.16 
 
 		 1016 aa  287  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2941  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.24 
 
 		 396 aa  285  7e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0220  PKD domain containing protein  43.64 
 
 		 705 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0937242  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0537  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.86 
 
 		 391 aa  281  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5254  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.2 
 
 		 447 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.668136 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02779  putative orphan protein  39.81 
 
 		 404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.313738  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3003  hypothetical protein  38.7 
 
 		 472 aa  237  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697597  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3335  hypothetical protein  36.78 
 
 		 463 aa  223  7e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000697045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3484  hypothetical protein  34.18 
 
 		 464 aa  216  5e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0729061 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000275  succinyl-CoA synthetase alpha subunit  35.4 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05881  phytase  35.96 
 
 		 454 aa  203  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2523  hypothetical protein  35.68 
 
 		 350 aa  187  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3763  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.99 
 
 		 341 aa  169  6e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0082  hypothetical protein  34.91 
 
 		 374 aa  168  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431101  normal  0.216389 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0125  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.62 
 
 		 279 aa  145  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2519  hypothetical protein  33.81 
 
 		 309 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0860  hypothetical protein  33.81 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6804  phytase  36.08 
 
 		 98 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.768619  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>