30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_15310 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_15310  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  100 
 
 		 396 aa  799    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.741887 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1530  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  68.11 
 
 		 672 aa  498  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  61.03 
 
 		 1016 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  59.16 
 
 		 1844 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0922  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  61.36 
 
 		 424 aa  424  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06470  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  56.44 
 
 		 411 aa  414  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2941  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  56.25 
 
 		 396 aa  398  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1102  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.93 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.530599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1073  protein of unknown function DUF1555  48.22 
 
 		 457 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0220  PKD domain containing protein  51.62 
 
 		 705 aa  358  7e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0937242  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5254  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.05 
 
 		 447 aa  345  7e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.668136 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1108  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.73 
 
 		 401 aa  340  2.9999999999999998e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3412  hypothetical protein  44.07 
 
 		 394 aa  325  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0537  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.92 
 
 		 391 aa  317  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04860  phytase  47.52 
 
 		 410 aa  316  4e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1964  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  41.65 
 
 		 394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.728612  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4972  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.81 
 
 		 398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02779  putative orphan protein  41.58 
 
 		 404 aa  285  9e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.313738  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3484  hypothetical protein  38.05 
 
 		 464 aa  249  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0729061 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3335  hypothetical protein  37.61 
 
 		 463 aa  248  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000697045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3003  hypothetical protein  38.8 
 
 		 472 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697597  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2523  hypothetical protein  41.26 
 
 		 350 aa  236  7e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000275  succinyl-CoA synthetase alpha subunit  37.12 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0082  hypothetical protein  38.58 
 
 		 374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431101  normal  0.216389 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05881  phytase  38.12 
 
 		 454 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3763  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.25 
 
 		 341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0125  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.98 
 
 		 279 aa  177  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2519  hypothetical protein  36.41 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0860  hypothetical protein  36.41 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6804  phytase  59.55 
 
 		 98 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.768619  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>