29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6804 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6804  phytase  100 
 
 
98 aa  196  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.768619  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1530  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  75 
 
 
672 aa  138  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  58.51 
 
 
1844 aa  120  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0922  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  65.56 
 
 
424 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06470  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  60.67 
 
 
411 aa  105  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  59 
 
 
1016 aa  103  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15310  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  59.55 
 
 
396 aa  98.6  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.741887 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1102  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  50 
 
 
457 aa  87.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.530599  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1073  protein of unknown function DUF1555  50 
 
 
457 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2941  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  57.32 
 
 
396 aa  85.5  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0082  hypothetical protein  53.85 
 
 
374 aa  79  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431101  normal  0.216389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5254  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.79 
 
 
447 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.668136 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2523  hypothetical protein  47.19 
 
 
350 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1108  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.08 
 
 
401 aa  64.3  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04860  phytase  37.93 
 
 
410 aa  60.8  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0125  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50 
 
 
279 aa  57.4  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4972  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.98 
 
 
398 aa  54.3  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11556  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3484  hypothetical protein  37.5 
 
 
464 aa  52.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0729061 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0220  PKD domain containing protein  53.57 
 
 
705 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0937242  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2519  hypothetical protein  45.9 
 
 
309 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0860  hypothetical protein  43.94 
 
 
309 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1964  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  44.44 
 
 
394 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.728612  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3003  hypothetical protein  45.83 
 
 
472 aa  52  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697597  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3412  hypothetical protein  50.91 
 
 
394 aa  52  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05881  phytase  37.37 
 
 
454 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0537  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.27 
 
 
391 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02779  putative orphan protein  52.73 
 
 
404 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.313738  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3335  hypothetical protein  35.11 
 
 
463 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000697045  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000275  succinyl-CoA synthetase alpha subunit  36.36 
 
 
454 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>