More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0402 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 219 aa  427  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  25.63 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  52.73 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  33.06 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 233 aa  62  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0169  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 321 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2630  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 321 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1313  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 321 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2773  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 321 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0142  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 288 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  48.48 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1036  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  32.02 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  53.45 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  51.67 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  29.5 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  49.21 
 
 		 326 aa  58.9  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1362  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  29.41 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2016  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  41.38 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  56.36 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 269 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 291 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>