More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0884 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 188 aa  387  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  50.57 
 
 		 181 aa  180  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1960  secreted protein  50 
 
 		 181 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  48.85 
 
 		 195 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  47.77 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  42.46 
 
 		 190 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  36.9 
 
 		 187 aa  137  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  36.96 
 
 		 199 aa  135  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  42.21 
 
 		 197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  42.31 
 
 		 193 aa  131  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  36.41 
 
 		 195 aa  128  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  45.34 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  36.71 
 
 		 663 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1328  Lytic transglycosylase catalytic  34.29 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  33.76 
 
 		 798 aa  105  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  34.39 
 
 		 777 aa  105  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2022  lytic transglycosylase, catalytic  36.88 
 
 		 166 aa  104  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  38.41 
 
 		 690 aa  101  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  35.03 
 
 		 730 aa  101  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  35.03 
 
 		 730 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  37.16 
 
 		 649 aa  100  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  31.41 
 
 		 782 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  36.49 
 
 		 649 aa  99.8  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  34.84 
 
 		 603 aa  99.4  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  38.64 
 
 		 166 aa  99.4  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2342  Lytic transglycosylase catalytic  32.28 
 
 		 219 aa  99.4  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000870082  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 		 735 aa  97.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  38.16 
 
 		 698 aa  96.7  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  38.16 
 
 		 715 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  34.62 
 
 		 731 aa  95.9  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2280  Slt family transglycosylase  35.26 
 
 		 688 aa  95.5  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0376  Lytic transglycosylase catalytic  30.72 
 
 		 730 aa  94.4  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  37.16 
 
 		 637 aa  94.4  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  33.76 
 
 		 593 aa  93.6  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  33.97 
 
 		 729 aa  93.6  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  34.59 
 
 		 724 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2874  Lytic transglycosylase catalytic  34.34 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0680806  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  33.76 
 
 		 593 aa  93.2  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  37.18 
 
 		 669 aa  93.2  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  31.01 
 
 		 833 aa  93.2  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  32.89 
 
 		 660 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  32.72 
 
 		 651 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  32.72 
 
 		 651 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  32.68 
 
 		 654 aa  90.5  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  32.72 
 
 		 651 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  32.72 
 
 		 651 aa  90.5  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  32.72 
 
 		 651 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  32.72 
 
 		 651 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  32.72 
 
 		 651 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  32.72 
 
 		 651 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  35.76 
 
 		 677 aa  89.4  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  33.12 
 
 		 661 aa  88.2  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  35.57 
 
 		 661 aa  87.8  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2415  lytic transglycosylase catalytic  38.61 
 
 		 643 aa  87.4  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.853717  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  31.61 
 
 		 756 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  32.89 
 
 		 748 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  36.18 
 
 		 721 aa  87  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  35.29 
 
 		 643 aa  86.7  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  34.42 
 
 		 719 aa  87  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  32.3 
 
 		 650 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  32.43 
 
 		 642 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  32.43 
 
 		 642 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  32.3 
 
 		 650 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2441  lytic transglycosylase, catalytic  37.41 
 
 		 300 aa  85.9  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0168706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  35.37 
 
 		 657 aa  85.9  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  35.37 
 
 		 657 aa  85.9  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  34.64 
 
 		 653 aa  85.5  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  33.75 
 
 		 720 aa  85.5  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  31.68 
 
 		 650 aa  85.9  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  36.43 
 
 		 296 aa  85.5  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  32.48 
 
 		 747 aa  85.1  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  33.11 
 
 		 642 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  33.11 
 
 		 643 aa  85.1  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  28.39 
 
 		 800 aa  84.7  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5914  Lytic transglycosylase catalytic  32.7 
 
 		 797 aa  83.6  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  31.68 
 
 		 650 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  33.11 
 
 		 642 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  31.68 
 
 		 607 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  35.03 
 
 		 693 aa  84  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  31.68 
 
 		 650 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  33.14 
 
 		 643 aa  84  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  31.41 
 
 		 661 aa  84.3  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  31.68 
 
 		 650 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  38.12 
 
 		 650 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  33.11 
 
 		 642 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  33.56 
 
 		 671 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  33.77 
 
 		 645 aa  82.8  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  32.7 
 
 		 648 aa  82.4  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  35.48 
 
 		 642 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  33.78 
 
 		 647 aa  82  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0176  Lytic transglycosylase catalytic  34.38 
 
 		 556 aa  82  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  39.42 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  32.43 
 
 		 657 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  32.43 
 
 		 641 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  32.43 
 
 		 649 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1597  soluble lytic murein transglycosylase precursor  33.99 
 
 		 651 aa  81.6  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.116163  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1603  lytic transglycosylase  32.08 
 
 		 830 aa  80.9  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.807223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>