More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2274 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  45.5 
 
 
853 aa  695    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  45.66 
 
 
1059 aa  698    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  44.03 
 
 
958 aa  697    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  45.53 
 
 
853 aa  701    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  42.69 
 
 
850 aa  658    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  46.24 
 
 
853 aa  711    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  44.86 
 
 
895 aa  684    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  43.3 
 
 
868 aa  662    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  44.28 
 
 
895 aa  681    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  46.72 
 
 
1057 aa  712    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  46.48 
 
 
1074 aa  705    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  45.75 
 
 
892 aa  685    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  45.94 
 
 
923 aa  696    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  44.44 
 
 
850 aa  673    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  43.83 
 
 
852 aa  654    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  92.2 
 
 
869 aa  1588    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  91.96 
 
 
875 aa  1618    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
871 aa  1779    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  44.33 
 
 
850 aa  672    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  44.74 
 
 
895 aa  681    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  47.32 
 
 
1063 aa  704    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  47.32 
 
 
1063 aa  704    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  44.44 
 
 
850 aa  673    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  44.69 
 
 
895 aa  686    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  46.36 
 
 
1057 aa  697    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  44.47 
 
 
891 aa  684    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  47.32 
 
 
1063 aa  707    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  40.35 
 
 
957 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  41.69 
 
 
843 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  40.64 
 
 
910 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  41.1 
 
 
843 aa  572  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  44.26 
 
 
730 aa  557  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  45.77 
 
 
847 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  37.92 
 
 
855 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  39.48 
 
 
890 aa  509  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  36.78 
 
 
851 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  36.23 
 
 
853 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  37.75 
 
 
835 aa  465  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2142  Rhs element Vgr protein  35.29 
 
 
961 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0933  Rhs element Vgr protein, putative  36.5 
 
 
780 aa  432  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218046  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1531  Rhs element Vgr protein, putative  36.38 
 
 
780 aa  432  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.398232  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6904  Rhs element Vgr protein  33.67 
 
 
928 aa  412  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  33.15 
 
 
911 aa  411  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  33.33 
 
 
886 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  32.98 
 
 
933 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4173  type VI secretion system Vgr family protein  35.45 
 
 
784 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  33.77 
 
 
975 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0636  Rhs element Vgr protein  33.07 
 
 
912 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  33.77 
 
 
918 aa  392  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  33.15 
 
 
1094 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  32.57 
 
 
928 aa  385  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  31.85 
 
 
901 aa  385  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  32.79 
 
 
968 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  32.51 
 
 
906 aa  385  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  33.16 
 
 
979 aa  382  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  31.94 
 
 
906 aa  381  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  33.78 
 
 
1019 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  33.09 
 
 
1019 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  36.83 
 
 
618 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  33.29 
 
 
898 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  33.46 
 
 
842 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  32.2 
 
 
847 aa  361  3e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  37.08 
 
 
613 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  37.7 
 
 
661 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  37.52 
 
 
661 aa  356  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  37.35 
 
 
661 aa  356  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  37.17 
 
 
661 aa  355  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  37.17 
 
 
661 aa  355  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  37.17 
 
 
661 aa  355  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  37.17 
 
 
661 aa  355  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  35.68 
 
 
616 aa  353  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  35.74 
 
 
618 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  37.28 
 
 
661 aa  351  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  30.95 
 
 
1048 aa  347  6e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  35.49 
 
 
614 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  32.13 
 
 
822 aa  337  5e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  31.59 
 
 
837 aa  335  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  31.28 
 
 
885 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  32.18 
 
 
1284 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  36.07 
 
 
703 aa  325  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  29.62 
 
 
841 aa  324  5e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  29.42 
 
 
838 aa  323  9.000000000000001e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  29.46 
 
 
841 aa  323  9.999999999999999e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  29.34 
 
 
841 aa  321  3e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  31.81 
 
 
1284 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  29.54 
 
 
920 aa  318  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01940  putative VGR-related protein  30.9 
 
 
1006 aa  316  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  31.27 
 
 
918 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  28.08 
 
 
902 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04687  putative VGR-related protein  30.73 
 
 
962 aa  314  3.9999999999999997e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  30.26 
 
 
834 aa  314  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  30.14 
 
 
834 aa  314  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  30.02 
 
 
834 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  29.65 
 
 
862 aa  311  5e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00004  Rhs element Vgr protein, putative  35.28 
 
 
748 aa  310  1.0000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  30.49 
 
 
920 aa  306  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  29.44 
 
 
845 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  29.77 
 
 
941 aa  304  6.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  30.36 
 
 
920 aa  303  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3371  type VI secretion system Vgr family protein  28.96 
 
 
922 aa  300  9e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>