159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4174 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4174  PKD domain containing protein  100 
 
 		 284 aa  578  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0180807 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  35.58 
 
 		 840 aa  59.7  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.5 
 
 		 699 aa  59.7  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  48.61 
 
 		 1094 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  43.9 
 
 		 735 aa  56.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  38.2 
 
 		 1194 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.32 
 
 		 945 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  39.08 
 
 		 958 aa  53.1  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  51.11 
 
 		 777 aa  52.8  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  37.04 
 
 		 586 aa  52.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  46.94 
 
 		 940 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0124  peptidase M6, immune inhibitor A  51.85 
 
 		 856 aa  52  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000205942  unclonable  0.000000000253026 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.59 
 
 		 835 aa  51.6  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  43.06 
 
 		 679 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  52.63 
 
 		 819 aa  50.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  51.85 
 
 		 936 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  51.85 
 
 		 936 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  40.91 
 
 		 978 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  43.06 
 
 		 685 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  43.06 
 
 		 669 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  41.54 
 
 		 752 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  41.54 
 
 		 1682 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4230  peptidase M6, immune inhibitor A  41.03 
 
 		 871 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.187448  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0128  M6 family metalloprotease domain protein  56.1 
 
 		 865 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.51 
 
 		 836 aa  49.3  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  43.06 
 
 		 675 aa  49.3  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  40.35 
 
 		 408 aa  49.3  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0124  peptidase M6 immune inhibitor A  41.03 
 
 		 867 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  38.16 
 
 		 818 aa  48.9  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  38.81 
 
 		 859 aa  48.9  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0466  microbial collagenase  39.34 
 
 		 965 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  42.03 
 
 		 840 aa  48.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  46 
 
 		 1667 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  55.56 
 
 		 935 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  45.1 
 
 		 869 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  45.1 
 
 		 581 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  45.28 
 
 		 644 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  46.3 
 
 		 1282 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  29.17 
 
 		 2176 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  41.79 
 
 		 951 aa  48.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  48.94 
 
 		 869 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0828059  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  56.82 
 
 		 528 aa  48.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  44.44 
 
 		 965 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0616  collagenase,putative  42.59 
 
 		 965 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1336  PKD domain containing protein  36.36 
 
 		 567 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  31.18 
 
 		 930 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  43.28 
 
 		 3295 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  40.3 
 
 		 575 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  53.85 
 
 		 1862 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3126  PKD  32.26 
 
 		 1162 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0241283  unclonable  0.0000395166 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  43.75 
 
 		 786 aa  47  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  37.33 
 
 		 2036 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4748  putative microbial collagenase  42.59 
 
 		 965 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.369378 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  32.35 
 
 		 861 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  43.86 
 
 		 1380 aa  47  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  48.72 
 
 		 1111 aa  46.6  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  34.92 
 
 		 945 aa  46.6  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0129  M6 family metalloprotease  51.06 
 
 		 871 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  45.24 
 
 		 719 aa  46.6  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  40.58 
 
 		 1620 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  42.86 
 
 		 1969 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  40.58 
 
 		 1602 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  28.85 
 
 		 1814 aa  46.6  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  37.63 
 
 		 2980 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  35.29 
 
 		 2552 aa  46.6  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  36.99 
 
 		 938 aa  46.6  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  45.1 
 
 		 658 aa  46.2  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  28.21 
 
 		 1027 aa  46.2  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  42.59 
 
 		 965 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  40.98 
 
 		 1356 aa  45.8  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  45.1 
 
 		 713 aa  46.2  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  32.94 
 
 		 1311 aa  45.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  34.33 
 
 		 1095 aa  45.8  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  57.58 
 
 		 870 aa  45.8  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0591  putative microbial collagenase  42.59 
 
 		 965 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  41.18 
 
 		 1842 aa  45.8  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  38.6 
 
 		 819 aa  45.8  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  51.28 
 
 		 792 aa  45.8  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4827  M6 family metalloprotease  50 
 
 		 965 aa  45.8  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  38.71 
 
 		 910 aa  45.8  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  33.33 
 
 		 938 aa  45.8  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  42.86 
 
 		 2272 aa  45.8  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  33.33 
 
 		 929 aa  45.8  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0523  collagenase,putative  42 
 
 		 965 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.415307  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  41.18 
 
 		 960 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  48.72 
 
 		 971 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0466  microbial collagenase  42 
 
 		 965 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0113001  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  38.81 
 
 		 2000 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0555  collagenase,putative  42 
 
 		 965 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  41.18 
 
 		 960 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  48.72 
 
 		 971 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  37.88 
 
 		 845 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1683  PKD  50 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  48.72 
 
 		 971 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11488  serine protease, subtilase family protein  32.91 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.53 
 
 		 835 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.67 
 
 		 1158 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  43.14 
 
 		 967 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  42.59 
 
 		 1361 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  39.71 
 
 		 460 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>