118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3202 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3202  cellulase  100 
 
 		 743 aa  1528    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000270074  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  37.59 
 
 		 681 aa  348  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3335  Cellulase  34.59 
 
 		 578 aa  310  6.999999999999999e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59527  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  31.96 
 
 		 593 aa  277  6e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4946  Cellulase  33.57 
 
 		 589 aa  271  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0257714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4876  Cellulase  33.75 
 
 		 572 aa  261  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  29.75 
 
 		 545 aa  230  7e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  33.02 
 
 		 814 aa  173  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08068  extracellular endoglucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01830)  27.34 
 
 		 572 aa  159  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  34.2 
 
 		 621 aa  159  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  28.44 
 
 		 475 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0774  glycoside hydrolase family protein  28.92 
 
 		 502 aa  138  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  33.33 
 
 		 516 aa  139  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2058  cellulase  27.96 
 
 		 469 aa  127  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.33329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0325  dihydroxy-acid dehydratase  28.45 
 
 		 451 aa  126  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.375618  normal  0.486344 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  27.71 
 
 		 584 aa  124  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  27.99 
 
 		 900 aa  110  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  27.98 
 
 		 566 aa  107  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  25.75 
 
 		 335 aa  96.3  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  27.22 
 
 		 673 aa  89  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  24.86 
 
 		 335 aa  88.2  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  26.01 
 
 		 461 aa  87.8  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  25.65 
 
 		 343 aa  86.3  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  35.6 
 
 		 846 aa  85.5  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  25.48 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  24.14 
 
 		 332 aa  76.3  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  49.43 
 
 		 1281 aa  74.3  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  38.38 
 
 		 491 aa  70.5  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  34.3 
 
 		 609 aa  70.5  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  38.95 
 
 		 364 aa  67  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  24.65 
 
 		 332 aa  66.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4013  peptidoglycan-binding LysM  57.38 
 
 		 203 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  39.36 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  38.41 
 
 		 694 aa  57.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  40.83 
 
 		 756 aa  57.4  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  32.91 
 
 		 942 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  33.98 
 
 		 934 aa  55.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  49.23 
 
 		 202 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1516  MerR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 201 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.699928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  33.7 
 
 		 511 aa  53.9  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1281  hypothetical protein  52 
 
 		 430 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.197658 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  49.37 
 
 		 455 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  58.33 
 
 		 433 aa  53.9  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  56.25 
 
 		 778 aa  52.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  62.5 
 
 		 1034 aa  52  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0528  hypothetical protein  52.08 
 
 		 431 aa  52  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  44.26 
 
 		 667 aa  51.2  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  30.85 
 
 		 906 aa  50.8  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  27.59 
 
 		 674 aa  50.8  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  53.33 
 
 		 449 aa  50.8  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 812 aa  51.2  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5165  hypothetical protein  32 
 
 		 570 aa  50.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0452988 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0633  hypothetical protein  31.91 
 
 		 436 aa  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.746615  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3396  rare lipoprotein A  30.56 
 
 		 351 aa  50.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160784 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  43.33 
 
 		 830 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  57.89 
 
 		 771 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  28.41 
 
 		 925 aa  49.7  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.21 
 
 		 261 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  62.07 
 
 		 453 aa  50.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.09 
 
 		 257 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.59 
 
 		 984 aa  48.9  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  54.9 
 
 		 628 aa  49.3  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  35.11 
 
 		 268 aa  49.3  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  31.63 
 
 		 894 aa  48.9  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  26.71 
 
 		 794 aa  48.1  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  27.55 
 
 		 674 aa  47.4  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  32.5 
 
 		 422 aa  47  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2774  cellulose-binding family II  34.21 
 
 		 89 aa  47  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.691497  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  42.65 
 
 		 914 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  32.5 
 
 		 456 aa  47  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  28.85 
 
 		 460 aa  47  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  50 
 
 		 916 aa  47.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  29.7 
 
 		 1194 aa  46.6  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  32.04 
 
 		 681 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  36.47 
 
 		 990 aa  47.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  34.44 
 
 		 580 aa  47.4  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  32.22 
 
 		 2310 aa  46.6  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  30.07 
 
 		 474 aa  46.6  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3681  peptidase C60 sortase A and B  38.81 
 
 		 243 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464105  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0580  hypothetical protein  31.93 
 
 		 253 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.306305  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  31.63 
 
 		 459 aa  46.2  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0840  cellulose-binding family II  30.1 
 
 		 313 aa  46.6  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0728  cellulosome anchoring protein cohesin region  54 
 
 		 1546 aa  46.2  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  26.73 
 
 		 543 aa  46.6  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  51.52 
 
 		 671 aa  45.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  28.41 
 
 		 847 aa  45.8  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  30.17 
 
 		 773 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  22.16 
 
 		 377 aa  45.8  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  27.27 
 
 		 674 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  21.43 
 
 		 590 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  28.28 
 
 		 674 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8080  Serine/threonine protein kinase-like protein  50.85 
 
 		 726 aa  45.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28031  hypothetical protein  28.81 
 
 		 533 aa  45.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1469  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.75 
 
 		 445 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854841  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1598  hypothetical protein  46.27 
 
 		 675 aa  45.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000695683  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  54.69 
 
 		 1394 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  37.04 
 
 		 500 aa  45.4  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  41.43 
 
 		 489 aa  45.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  31.71 
 
 		 561 aa  45.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  28.71 
 
 		 347 aa  45.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>