More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1818 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1818  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 355 aa  715    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  32 
 
 		 522 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  30.61 
 
 		 514 aa  153  5e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1293  pyruvate carboxyltransferase  32.35 
 
 		 393 aa  150  4e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0122344 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1624  pyruvate carboxyltransferase  27.78 
 
 		 388 aa  149  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  30.61 
 
 		 514 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  30.91 
 
 		 502 aa  146  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  28.76 
 
 		 514 aa  146  6e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  29.95 
 
 		 460 aa  145  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  29.07 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  29.27 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  30.7 
 
 		 514 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  32.09 
 
 		 386 aa  142  8e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1624  pyruvate carboxyltransferase  29.03 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.273751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  28.84 
 
 		 490 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  30.91 
 
 		 377 aa  140  3e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  29.91 
 
 		 386 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  31.66 
 
 		 492 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  29.41 
 
 		 385 aa  139  7.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  29.52 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  30.37 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  27.85 
 
 		 505 aa  137  4e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1747  pyruvate carboxyltransferase  27.01 
 
 		 383 aa  137  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.73975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  29.81 
 
 		 515 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  30.37 
 
 		 386 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  30 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  29.74 
 
 		 500 aa  134  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  27.39 
 
 		 394 aa  134  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  29.44 
 
 		 514 aa  133  5e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  28.03 
 
 		 377 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  28.65 
 
 		 378 aa  132  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  29.68 
 
 		 492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  28.46 
 
 		 511 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  28.14 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2367  trans-homoaconitate synthase  28 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  28.34 
 
 		 491 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  26.26 
 
 		 381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  29.38 
 
 		 521 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  28.26 
 
 		 377 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  30.75 
 
 		 492 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0859  2-isopropylmalate synthase  28.46 
 
 		 515 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  28.24 
 
 		 513 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  30.05 
 
 		 512 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  30.21 
 
 		 492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  28.07 
 
 		 377 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1229  homocitrate synthase  26.81 
 
 		 381 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1919  homocitrate synthase  27.15 
 
 		 375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00307593  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  29.78 
 
 		 516 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2282  2-isopropylmalate synthase  28.03 
 
 		 527 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  28.69 
 
 		 509 aa  127  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0150  homocitrate synthase  28.69 
 
 		 415 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  28 
 
 		 387 aa  127  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  30.77 
 
 		 492 aa  126  5e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  27.98 
 
 		 513 aa  126  5e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1059  pyruvate carboxyltransferase  30 
 
 		 377 aa  126  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1372  homocitrate synthase  28.19 
 
 		 377 aa  126  7e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  26.63 
 
 		 479 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0690  homocitrate synthase  27.52 
 
 		 389 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.784168  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0833  pyruvate carboxyltransferase  27.96 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  26.96 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  28.34 
 
 		 520 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3466  trans-homoaconitate synthase  27.47 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  27.99 
 
 		 521 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  26.53 
 
 		 376 aa  125  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  28.57 
 
 		 516 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  28.42 
 
 		 509 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  27.15 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  29.16 
 
 		 512 aa  123  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89386  homocitrate synthase  27.45 
 
 		 419 aa  123  4e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  29.76 
 
 		 515 aa  123  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  27.42 
 
 		 390 aa  123  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0014  pyruvate carboxyltransferase  28.68 
 
 		 398 aa  124  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  29.38 
 
 		 514 aa  123  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  27.99 
 
 		 519 aa  123  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  27.06 
 
 		 405 aa  123  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  27.49 
 
 		 507 aa  122  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  28.65 
 
 		 517 aa  122  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  28.81 
 
 		 503 aa  122  8e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  25.61 
 
 		 383 aa  122  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  29.62 
 
 		 515 aa  122  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  27.5 
 
 		 520 aa  122  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  29.89 
 
 		 515 aa  122  9e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0683  2-isopropylmalate synthase  29.35 
 
 		 526 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  26.95 
 
 		 383 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  28.96 
 
 		 514 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  28.57 
 
 		 527 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  28.69 
 
 		 507 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1808  2-isopropylmalate synthase  27.93 
 
 		 475 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.787559  hitchhiker  0.000060507 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1005  2-isopropylmalate synthase  27.65 
 
 		 529 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  27.25 
 
 		 520 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2330  2-isopropylmalate synthase  27.91 
 
 		 529 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  27.93 
 
 		 485 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  27.91 
 
 		 520 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1918  homocitrate synthase  29.23 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2393  homocitrate synthase  29.66 
 
 		 376 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.310246  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0214  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  30.99 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  31.56 
 
 		 524 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4489  pyruvate carboxyltransferase  27.17 
 
 		 398 aa  120  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  28.13 
 
 		 524 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  28.12 
 
 		 527 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>