More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1273 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1273  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 106 aa  218  1.9999999999999999e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.866565  hitchhiker  0.0000000994853 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1415  HxlR family transcriptional regulator  57.73 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0193281 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2818  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1635  transcriptional regulator, HxlR family  39.22 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168086  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1172  transcriptional regulator, HxlR family  38.14 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  37.89 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2054  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4559  transcriptional regulator, HxlR family  37.25 
 
 		 122 aa  67  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0265  HxlR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00635025  normal  0.325102 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3364  transcriptional regulator, HxlR family  35 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159843  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4029  transcriptional regulator, HxlR family  37.25 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2241  HxlR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.306938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1219  HxlR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000243781  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1542  transcriptional regulator, HxlR family  35.79 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2488  transcriptional regulator, HxlR family  30.56 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4912  helix-turn-helix, HxlR type  29.81 
 
 		 233 aa  63.9  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296479  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  35.29 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  35.56 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1262  transcriptional regulator, HxlR family  33.67 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1421  transcriptional regulator, HxlR family  34.38 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  31.63 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  34.04 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  39.36 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  32.67 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0273  transcriptional regulator, HxlR family  36.46 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.394727  normal  0.0155741 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2640  transcriptional regulator, HxlR family  36.46 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.954281  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0882  transcriptional regulator, HxlR family protein  33.68 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1522  hypothetical protein  36.27 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.181711  normal  0.471635 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 218 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  29.47 
 
 		 226 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0386  HxlR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  31.68 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1483  HxlR family transcriptional regulator  32 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 229 aa  60.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2378  transcriptional regulator, HxlR family  34.38 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.415672  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  34.74 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0141  HxlR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 187 aa  60.5  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.360575 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  34.74 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2190  putative transcriptional regulator  34.31 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000426745  normal  0.636756 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3339  HxlR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  31.31 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12340  predicted transcriptional regulator  34.41 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  33.02 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  30.48 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4220  HxlR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  32.97 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2645  transcriptional regulator, HxlR family  35.56 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6743  transcriptional regulator, HxlR family  39.13 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0160  HxlR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.159433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  30.61 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1171  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.299437  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0202  transcriptional regulator, HxlR family  35.05 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.537132 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0916  transcriptional regulator, HxlR family  32.98 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  32 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  32 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2194  HxlR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  32 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  33.7 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  32 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  35.56 
 
 		 218 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3732  HxlR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00142315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3973  HxlR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.0339732 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  29 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1397  transcriptional regulator, HxlR family  31.31 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0626  helix-turn-helix HxlR type  28.85 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  32 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  32 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2199  HxlR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  32 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  31.31 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  29 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3959  HxlR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4033  HxlR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1101  putative transcriptional regulator  33.66 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0283435 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3168  transcriptional regulator, HxlR family  28.87 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5760  transcriptional regulator, HxlR family  33.66 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.740827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  32 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>