More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08200 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_08200  small-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 257 aa  507  1e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.335106 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2569  MscS Mechanosensitive ion channel  39.85 
 
 		 321 aa  152  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19990  small-conductance mechanosensitive channel  38.93 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1106  small-conductance mechanosensitive channel  31.22 
 
 		 265 aa  122  6e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0383  MscS Mechanosensitive ion channel  31 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2357  hypothetical protein  28.77 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116724  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  32.09 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0015  MscS mechanosensitive ion channel  25.33 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  31.12 
 
 		 359 aa  72  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  30.07 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  30.73 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000167428  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  28.1 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  31.72 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  29.83 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0427  MscS mechanosensitive ion channel  29.08 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0918944  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  34.96 
 
 		 366 aa  67  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  35.97 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  31.61 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  37.04 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  31.61 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649067 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  25.66 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  32.31 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  28.88 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  30.43 
 
 		 813 aa  63.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.183155 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  27.62 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  35.4 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  30.46 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  27.86 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  28.24 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  34.51 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  36.94 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  26.96 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0042  MscS Mechanosensitive ion channel  29.37 
 
 		 375 aa  62.8  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634821  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0108  MscS mechanosensitive ion channel  38.24 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  29.5 
 
 		 276 aa  62  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  28.5 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4090  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0226  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.57 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.512445  normal  0.203081 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1210  MscS mechanosensitive ion channel  29.91 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  41.98 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  24.69 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1452  MscS mechanosensitive ion channel  32.24 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.678727  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  27.43 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  29.76 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1649  MscS Mechanosensitive ion channel  21.72 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00392  hypothetical protein  28.83 
 
 		 377 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.65965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5308  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.28 
 
 		 508 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119708 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3200  MscS mechanosensitive ion channel  35.23 
 
 		 590 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  30.11 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  30.11 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  30.11 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5329  mechanosensitive ion channel protein MscS  26.94 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  30.11 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  25.32 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  34.43 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  30.11 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  30.11 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  29.35 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  24.47 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  34.74 
 
 		 624 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  28.26 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  30.11 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0886  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.36483  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  30.11 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  30.11 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2479  MscS Mechanosensitive ion channel  29.23 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.827266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5256  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.36 
 
 		 475 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.584441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5166  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.36 
 
 		 475 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0740457  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1650  MscS mechanosensitive ion channel  38.96 
 
 		 570 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598293 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  24.68 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2171  MscS mechanosensitive ion channel  30.99 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0970  small-conductance mechanosensitive ion channel  37.66 
 
 		 650 aa  56.2  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371389 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1867  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  32.74 
 
 		 480 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0456814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4182  MscS mechanosensitive ion channel  28.7 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  33.59 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0308  MscS mechanosensitive ion channel  32.54 
 
 		 459 aa  56.2  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12461  transmembrane protein  26 
 
 		 481 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1446  MscS mechanosensitive ion channel  37.66 
 
 		 648 aa  55.8  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.770596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  26.06 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1822  MscS mechanosensitive ion channel  31.29 
 
 		 374 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00396347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4142  MscS mechanosensitive ion channel  33.66 
 
 		 384 aa  55.8  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.93898  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0253  mechanosensitive ion channel family protein  38.37 
 
 		 378 aa  55.8  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0247  mechanosensitive ion channel family protein  38.37 
 
 		 378 aa  55.8  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  26.49 
 
 		 627 aa  55.5  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  26.78 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  23.93 
 
 		 406 aa  55.5  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2989  Ricin B lectin  31.68 
 
 		 474 aa  55.5  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000129425 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3360  hypothetical protein  35.29 
 
 		 374 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1920  MscS Mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 377 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000103017  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2101  MscS Mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 377 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188968 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4194  MscS mechanosensitive ion channel  36.25 
 
 		 562 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1300  MscS mechanosensitive ion channel  26.04 
 
 		 343 aa  55.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.987941  hitchhiker  0.00895683 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1366  MscS Mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 377 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0389612  hitchhiker  0.000813003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1350  MscS Mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 377 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000205244  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  28.67 
 
 		 433 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>