More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0555 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 379 aa  779    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  46.26 
 
 		 370 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  46.63 
 
 		 369 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  47.37 
 
 		 380 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  45.61 
 
 		 370 aa  297  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  43.75 
 
 		 369 aa  296  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  46.2 
 
 		 380 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  43.75 
 
 		 369 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  44.02 
 
 		 369 aa  292  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  43.75 
 
 		 369 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  43.75 
 
 		 369 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  46.8 
 
 		 373 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  46.47 
 
 		 365 aa  289  7e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  46.47 
 
 		 379 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2459  histone deacetylase superfamily protein  45.88 
 
 		 379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  44.02 
 
 		 373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  47.59 
 
 		 371 aa  273  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2375  histone deacetylase family protein putative  43.48 
 
 		 369 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1010  histone deacetylase superfamily protein  44.35 
 
 		 366 aa  262  8.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.942652  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2491  histone deacetylase family protein  45.43 
 
 		 340 aa  258  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3337  histone deacetylase family protein  43.21 
 
 		 367 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.937629  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1968  histone deacetylase family protein  43.21 
 
 		 369 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2334  histone deacetylase family protein putative  42.93 
 
 		 369 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679895  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2111  histone deacetylase family protein  45.54 
 
 		 340 aa  250  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1475  histone deacetylase family protein  45.13 
 
 		 340 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.157085  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  40.6 
 
 		 344 aa  220  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  40.62 
 
 		 341 aa  217  2e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  39.26 
 
 		 352 aa  216  5e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  40.77 
 
 		 341 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0332  histone deacetylase family protein  43.08 
 
 		 350 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195031  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0125  histone deacetylase family protein putative  43.08 
 
 		 370 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  39.37 
 
 		 341 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2309  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  42.77 
 
 		 370 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2827  histone deacetylase family protein  42.77 
 
 		 370 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2258  histone deacetylase family protein  42.77 
 
 		 370 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2332  histone deacetylase family protein  42.77 
 
 		 370 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0124  histone deacetylase family protein  42.77 
 
 		 350 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0141  histone deacetylase family protein  43.65 
 
 		 370 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  37.39 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3860  Histone deacetylase  35.63 
 
 		 372 aa  203  3e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  39.27 
 
 		 345 aa  199  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  39.27 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  39.53 
 
 		 308 aa  195  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71431  predicted protein  37.43 
 
 		 807 aa  192  7e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.71958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  40.14 
 
 		 345 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  39.21 
 
 		 343 aa  192  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  40 
 
 		 315 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  39.18 
 
 		 344 aa  188  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  40.4 
 
 		 307 aa  187  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  35.22 
 
 		 316 aa  186  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  38.03 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  38.27 
 
 		 306 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  41.22 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  42.52 
 
 		 307 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  41.94 
 
 		 309 aa  178  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  42.06 
 
 		 326 aa  177  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  42 
 
 		 324 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  42 
 
 		 307 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  37.76 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87707  predicted protein  33.43 
 
 		 480 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  37.94 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  39.84 
 
 		 337 aa  172  5.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  39.67 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  39.09 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  37.86 
 
 		 307 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  33.73 
 
 		 344 aa  169  7e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  39.43 
 
 		 316 aa  169  7e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  42.72 
 
 		 311 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  39.61 
 
 		 307 aa  169  9e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  43.65 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  39.09 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  37.99 
 
 		 359 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  40.19 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2777  Histone deacetylase  37.59 
 
 		 368 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0178296  normal  0.0714175 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08042  Putative histone deacetylase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7Z8L7]  38.25 
 
 		 766 aa  167  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.714475 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  41.55 
 
 		 309 aa  168  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  37.86 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  34.93 
 
 		 314 aa  168  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  37.65 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  43.2 
 
 		 308 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  42.25 
 
 		 316 aa  167  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  34.39 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  41.75 
 
 		 311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  39.62 
 
 		 393 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0057  histone deacetylase superfamily protein  34.67 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.620754  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  39.51 
 
 		 309 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  37.86 
 
 		 307 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  35.8 
 
 		 364 aa  166  8e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  41.04 
 
 		 309 aa  166  9e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  42.06 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  30.5 
 
 		 737 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  34.74 
 
 		 378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  41.26 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  35.16 
 
 		 322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0416  histone deacetylase family protein  36.58 
 
 		 307 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2982  histone deacetylase family protein  36.58 
 
 		 307 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2560  histone deacetylase family protein  36.58 
 
 		 307 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  35.64 
 
 		 309 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2934  histone deacetylase family protein  36.58 
 
 		 307 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.664786  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0213  histone deacetylase family protein  36.58 
 
 		 307 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>