More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4649 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 186 aa  370  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  66.13 
 
 		 186 aa  260  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  47.34 
 
 		 191 aa  172  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  40.11 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  39.2 
 
 		 190 aa  117  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  38.29 
 
 		 193 aa  109  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 193 aa  108  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 192 aa  102  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 193 aa  101  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 193 aa  97.4  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  32.43 
 
 		 189 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  34.88 
 
 		 204 aa  95.1  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  32.43 
 
 		 189 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 189 aa  94.7  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  34.39 
 
 		 194 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 193 aa  90.9  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 194 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 205 aa  88.2  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 199 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 196 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  31.87 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 193 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 193 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 191 aa  85.1  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  32.95 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  31.61 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  25.93 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4133  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  32.2 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2958  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 186 aa  74.3  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 195 aa  72  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  27.62 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  27.32 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  28.05 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3295  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2843  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 209 aa  62  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  24.04 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  19.77 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  24.21 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6399  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0216  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  21.47 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5526  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_5890  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223104  normal  0.394498 
 
 
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NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
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NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  23.5 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
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NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
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NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  21.39 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 206 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_1297  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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