More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4286 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  100 
 
 		 347 aa  702    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  54.25 
 
 		 372 aa  371  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  50.82 
 
 		 359 aa  342  5e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  47.59 
 
 		 360 aa  298  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  48.64 
 
 		 358 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2948  chitin-binding domain 3 protein  55.41 
 
 		 306 aa  249  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0411375  hitchhiker  0.000170836 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  38.84 
 
 		 354 aa  226  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  46.84 
 
 		 443 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4563  chitin-binding domain 3 protein  56 
 
 		 212 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  46.67 
 
 		 438 aa  196  6e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  33.95 
 
 		 389 aa  186  4e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  48.61 
 
 		 429 aa  176  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  41.38 
 
 		 307 aa  172  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  41.67 
 
 		 400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  37.9 
 
 		 378 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  36.99 
 
 		 285 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  37.68 
 
 		 389 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  37.68 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  35.17 
 
 		 391 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  34.38 
 
 		 390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  26.99 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  33.19 
 
 		 393 aa  100  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  31.8 
 
 		 368 aa  97.4  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  45.92 
 
 		 422 aa  94  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  42.86 
 
 		 474 aa  93.2  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  44.79 
 
 		 773 aa  92.4  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  48.24 
 
 		 456 aa  92.4  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  33.33 
 
 		 201 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  42.86 
 
 		 486 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02190  hypothetical protein  32.29 
 
 		 497 aa  92  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  43.75 
 
 		 906 aa  90.5  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  31.17 
 
 		 402 aa  90.1  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  30.49 
 
 		 392 aa  89.7  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  41.84 
 
 		 847 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3518  chitin-binding domain 3 protein  32.59 
 
 		 235 aa  87  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  45.92 
 
 		 353 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  42.35 
 
 		 925 aa  86.3  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  27.2 
 
 		 351 aa  86.3  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  29.92 
 
 		 395 aa  85.9  9e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  43.12 
 
 		 673 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  41.84 
 
 		 493 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  45.54 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  38.61 
 
 		 913 aa  82.8  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1925  chitin binding domain-containing protein  29.26 
 
 		 449 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  39.86 
 
 		 978 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  51.22 
 
 		 593 aa  80.9  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3293  chitin-binding domain-containing protein  31.38 
 
 		 534 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3305  chitin binding domain-containing protein  31.38 
 
 		 534 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000109771  hitchhiker  0.000135909 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3154  chitin binding domain-containing protein  31.38 
 
 		 534 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  45.68 
 
 		 681 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1785  chitin binding domain-containing protein  29.07 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361699  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0777  chitin-binding protein  29.07 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.875326  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2045  chitin-binding protein  29.07 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.548348  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0759  chitin binding domain-containing protein  29.07 
 
 		 408 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0669  chitin-binding protein  29.07 
 
 		 408 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  40.82 
 
 		 448 aa  79.3  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  44.32 
 
 		 459 aa  79.7  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1070  chitin-binding protein  29.07 
 
 		 378 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  37.86 
 
 		 746 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2047  chitin binding domain-containing protein  29.07 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  41.12 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  36.94 
 
 		 744 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  38.61 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  40.59 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  43.62 
 
 		 460 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  37 
 
 		 628 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2475  chitin-binding domain 3 protein  30.25 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  37.89 
 
 		 1055 aa  77  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  34.51 
 
 		 609 aa  76.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  48.78 
 
 		 479 aa  76.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.75 
 
 		 984 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  38.14 
 
 		 491 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  37.14 
 
 		 543 aa  76.3  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4693  chitin-binding domain 3 protein  28.21 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  40.62 
 
 		 688 aa  76.3  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  42.53 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  43 
 
 		 349 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  28.99 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  41.05 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1268  putative secreted cellulose-binding protein  29.74 
 
 		 222 aa  75.1  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.459217  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  35.29 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  41.3 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  42.27 
 
 		 490 aa  73.9  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  31.16 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  26.5 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  38.64 
 
 		 455 aa  72.8  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  35.64 
 
 		 846 aa  73.2  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  24.43 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  37.5 
 
 		 518 aa  72.8  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  37.25 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  34.62 
 
 		 495 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  43 
 
 		 474 aa  71.2  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  39.39 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.18 
 
 		 979 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  39.39 
 
 		 775 aa  71.2  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  36.46 
 
 		 778 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  37.89 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  41.25 
 
 		 774 aa  70.5  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7566  hypothetical protein  39 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  35.42 
 
 		 633 aa  70.1  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>