More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0731 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0731  ROK family protein  100 
 
 		 372 aa  735    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2190  ROK family protein  40.11 
 
 		 374 aa  311  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1703  NagC family Transcriptional regulator  26.63 
 
 		 377 aa  181  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  33.13 
 
 		 381 aa  172  9e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  26.26 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5104  ROK family protein  24.87 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288839  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  22.9 
 
 		 402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  28.23 
 
 		 391 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  27.32 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  26.74 
 
 		 410 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1677  ROK family protein  23.59 
 
 		 435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  24.16 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  25.72 
 
 		 405 aa  123  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  26.46 
 
 		 400 aa  123  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  26.94 
 
 		 408 aa  122  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  26.59 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  25 
 
 		 399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  26.09 
 
 		 408 aa  119  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  22.08 
 
 		 414 aa  119  7.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  27.63 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  24.32 
 
 		 405 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0176  ROK family protein  22.19 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  25.45 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  24.32 
 
 		 384 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  27.47 
 
 		 378 aa  116  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  25.15 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  24.74 
 
 		 409 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  24.74 
 
 		 383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  22.86 
 
 		 408 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7220  ROK family protein  22.65 
 
 		 402 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.501197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  21.56 
 
 		 396 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  29.55 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  30.07 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  22.75 
 
 		 407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  25.13 
 
 		 395 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  25.8 
 
 		 381 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1887  NagC family Transcriptional regulator  22.81 
 
 		 409 aa  109  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103401  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  22.95 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  24.4 
 
 		 391 aa  107  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  22.42 
 
 		 386 aa  106  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  21.96 
 
 		 401 aa  105  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  22.22 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  25.13 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0509  ROK family protein  33.23 
 
 		 363 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0922541  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  27.79 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  20.88 
 
 		 401 aa  103  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  27.76 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  24.01 
 
 		 396 aa  103  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  19.79 
 
 		 404 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  26.28 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  22.7 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0225  ROK family protein  27.96 
 
 		 398 aa  102  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  27.53 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0705  ROK family protein  21.26 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  24.15 
 
 		 414 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0814  ROK family protein  27.11 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162994  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  22.81 
 
 		 392 aa  99.4  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  22.95 
 
 		 425 aa  99.8  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0043  ROK family protein  22.05 
 
 		 421 aa  99.4  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  20.78 
 
 		 389 aa  99.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  23.08 
 
 		 425 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  22.09 
 
 		 393 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  22.25 
 
 		 417 aa  97.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  20.59 
 
 		 397 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  24.22 
 
 		 404 aa  97.8  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1108  ROK family protein  21.81 
 
 		 382 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  24.91 
 
 		 315 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  24.91 
 
 		 315 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  21.12 
 
 		 425 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01250  transcriptional regulator/sugar kinase  20.56 
 
 		 424 aa  97.4  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  23.55 
 
 		 404 aa  97.1  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  23.19 
 
 		 410 aa  96.7  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  24.21 
 
 		 417 aa  96.7  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  20.34 
 
 		 410 aa  96.7  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  22.25 
 
 		 434 aa  96.7  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0316  ROK family protein  27.1 
 
 		 388 aa  96.3  7e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  21.3 
 
 		 400 aa  96.3  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  23.24 
 
 		 435 aa  96.3  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  24.52 
 
 		 404 aa  95.5  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  24.52 
 
 		 404 aa  95.9  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  20.58 
 
 		 397 aa  95.5  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  22.29 
 
 		 405 aa  94.7  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  20.63 
 
 		 400 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  25.48 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  24.14 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  26.87 
 
 		 387 aa  94.7  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0208  NagC family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  22.47 
 
 		 414 aa  94.4  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  26.45 
 
 		 396 aa  94  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  27.15 
 
 		 291 aa  93.6  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  21.93 
 
 		 396 aa  93.6  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  23.75 
 
 		 342 aa  93.2  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  22.88 
 
 		 390 aa  93.2  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  20.23 
 
 		 427 aa  93.2  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  20.93 
 
 		 418 aa  92.8  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06180  transcriptional regulator/sugar kinase  24.47 
 
 		 406 aa  92  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  29.73 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  21.74 
 
 		 429 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  22.94 
 
 		 372 aa  91.3  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  29.23 
 
 		 400 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>