More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0366 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  456  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  48.61 
 
 		 222 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  45.63 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  46.19 
 
 		 218 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  39.07 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  39.07 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  39.23 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  41.18 
 
 		 235 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  41.46 
 
 		 229 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  35.27 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  35.27 
 
 		 225 aa  121  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  37.95 
 
 		 224 aa  118  6e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 226 aa  118  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  35.92 
 
 		 223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  34.87 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  33.49 
 
 		 233 aa  112  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  33.17 
 
 		 230 aa  111  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  36.81 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  32.56 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  36.14 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  35.57 
 
 		 215 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  40.49 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  34.36 
 
 		 252 aa  105  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  31.75 
 
 		 230 aa  105  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 216 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  29.9 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  29.38 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  33.01 
 
 		 241 aa  102  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 337 aa  99.8  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  27.96 
 
 		 216 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 235 aa  99.4  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  29.25 
 
 		 231 aa  99.4  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  36.68 
 
 		 224 aa  99  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  28.57 
 
 		 227 aa  98.6  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  28.91 
 
 		 231 aa  98.2  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 233 aa  96.7  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  33.51 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 236 aa  95.5  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  38.15 
 
 		 226 aa  95.5  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  30.41 
 
 		 245 aa  95.1  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  32.69 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  37.34 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  32.06 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  30.52 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  28.5 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 218 aa  92.8  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 218 aa  92.8  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 218 aa  92.8  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  36.16 
 
 		 241 aa  92.8  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 218 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 218 aa  92  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 218 aa  92  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  29.33 
 
 		 239 aa  92  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 218 aa  92  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 255 aa  92  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  29.46 
 
 		 225 aa  92  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 218 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2418  GntR domain protein  28.04 
 
 		 251 aa  91.7  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172286  decreased coverage  0.00114845 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 218 aa  91.3  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  31.84 
 
 		 218 aa  91.7  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  32.75 
 
 		 250 aa  90.9  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  27.36 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  30.14 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  31.56 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2102  transcription regulator protein  27.96 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  29.82 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 230 aa  90.1  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  30.43 
 
 		 235 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  29.59 
 
 		 249 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  31.5 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 241 aa  89.4  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3082  GntR domain-containing protein  30.84 
 
 		 241 aa  89.4  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0951451 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0553  GntR domain protein  29.73 
 
 		 253 aa  89  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  29.82 
 
 		 239 aa  89  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  31.96 
 
 		 227 aa  89.4  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 243 aa  88.6  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  30.43 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6745  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  30.77 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  30.99 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  29.78 
 
 		 258 aa  86.3  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  26.94 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  26.94 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  28.77 
 
 		 258 aa  86.3  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  32.27 
 
 		 249 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  29.3 
 
 		 237 aa  85.9  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 258 aa  85.5  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  28.44 
 
 		 243 aa  85.1  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  27.52 
 
 		 238 aa  85.1  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>