240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1576 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1576  ipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 
344 aa  700    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.426567  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1652  ipid-A-disaccharide synthase  80.35 
 
 
347 aa  574  1.0000000000000001e-163  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000716832  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0326  ipid-A-disaccharide synthase  67.35 
 
 
343 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1311  ipid-A-disaccharide synthase  63.05 
 
 
344 aa  445  1.0000000000000001e-124  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0200  lipid-A-disaccharide synthase  58.6 
 
 
343 aa  395  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0188024  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0336  ipid-A-disaccharide synthase  56.51 
 
 
364 aa  394  1e-108  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1683  ipid-A-disaccharide synthase  56.15 
 
 
364 aa  389  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0568935  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1373  ipid-A-disaccharide synthase  56.15 
 
 
364 aa  387  1e-106  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0314  ipid-A-disaccharide synthase  55.96 
 
 
364 aa  387  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0903  ipid-A-disaccharide synthase  50 
 
 
348 aa  339  4e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  30.92 
 
 
381 aa  162  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  35.47 
 
 
376 aa  156  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  32.08 
 
 
384 aa  153  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  32.47 
 
 
384 aa  153  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  32.93 
 
 
387 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  31.03 
 
 
383 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0104  lipid-A-disaccharide synthase  33.68 
 
 
355 aa  149  5e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000837929  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  32.71 
 
 
367 aa  149  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 
384 aa  149  9e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  34.27 
 
 
393 aa  146  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  30.06 
 
 
410 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  31.86 
 
 
376 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  32.54 
 
 
384 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  29.33 
 
 
388 aa  143  4e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  34.78 
 
 
411 aa  142  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  29.87 
 
 
376 aa  142  8e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  31.75 
 
 
380 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  32.97 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  31.9 
 
 
388 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  30.29 
 
 
371 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  30.08 
 
 
378 aa  140  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  31.64 
 
 
380 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  32.53 
 
 
397 aa  139  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  29.46 
 
 
376 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  30.65 
 
 
402 aa  138  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  30.91 
 
 
384 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  30.43 
 
 
388 aa  138  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  31.42 
 
 
389 aa  138  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  31.64 
 
 
379 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 
382 aa  136  7.000000000000001e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  30.63 
 
 
372 aa  135  8e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  29.14 
 
 
370 aa  135  8e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  29.32 
 
 
386 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  34 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1143  lipid-A-disaccharide synthase  32.41 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0582133  normal  0.762709 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  32.69 
 
 
383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  32.76 
 
 
392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  32.78 
 
 
383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2041  lipid-A-disaccharide synthase  34.14 
 
 
394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.819903  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1707  lipid-A-disaccharide synthase  31.33 
 
 
396 aa  134  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  32.29 
 
 
380 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  34.09 
 
 
380 aa  133  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  28.15 
 
 
382 aa  133  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  29.55 
 
 
380 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  31.95 
 
 
377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  28.74 
 
 
383 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1175  lipid-A-disaccharide synthase  30.56 
 
 
375 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.165605  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1459  lipid A disaccharide synthase LpxB  30.56 
 
 
375 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  30.99 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 
380 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  30.51 
 
 
376 aa  129  5.0000000000000004e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  29.62 
 
 
379 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  29.91 
 
 
383 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  30.49 
 
 
378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  29.34 
 
 
384 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  29.23 
 
 
385 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  30.03 
 
 
384 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  29.15 
 
 
392 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  28 
 
 
376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1149  lipid-A-disaccharide synthase  30.46 
 
 
395 aa  126  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1286  lipid-A-disaccharide synthase  29.91 
 
 
368 aa  126  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.110727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1107  lipid-A-disaccharide synthase  30.46 
 
 
395 aa  126  5e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0823  lipid-A-disaccharide synthase  29.1 
 
 
363 aa  126  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  31.29 
 
 
375 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1438  lipid-A-disaccharide synthase  29.06 
 
 
401 aa  125  7e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.14396  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  32.2 
 
 
368 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2162  lipid A disaccharide synthase  29.43 
 
 
383 aa  125  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  30.93 
 
 
380 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1599  Lipid-A-disaccharide synthase  28.66 
 
 
407 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  29.07 
 
 
382 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  29.33 
 
 
380 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  29.01 
 
 
377 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2448  lipid-A-disaccharide synthase  28.62 
 
 
384 aa  123  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  hitchhiker  0.000620569 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05531  lipid-A-disaccharide synthase  28.38 
 
 
392 aa  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  30.31 
 
 
375 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  32 
 
 
388 aa  122  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  30.56 
 
 
375 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2815  lipid-A-disaccharide synthase  30.93 
 
 
393 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  30.27 
 
 
380 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1846  lipid-A-disaccharide synthase  30.41 
 
 
396 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.309879  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2682  lipid-A-disaccharide synthase  31.94 
 
 
376 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.699358  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2844  lipid-A-disaccharide synthase  30.8 
 
 
393 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.809049 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  28.49 
 
 
385 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0943  lipid-A-disaccharide synthase  29.31 
 
 
391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  31.38 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1374  lipid-A-disaccharide synthase  27.67 
 
 
379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.698361  normal  0.0541377 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1542  lipid-A-disaccharide synthase  30.69 
 
 
388 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132773  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2479  lipid-A-disaccharide synthase  30.69 
 
 
388 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.40409  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  31.77 
 
 
380 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2042  lipid-A-disaccharide synthase  30.69 
 
 
388 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>