More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5146 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5146  ABC transporter related  100 
 
 		 245 aa  492  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2450  ABC transporter related  66.09 
 
 		 233 aa  306  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2057  ABC transporter related  65.67 
 
 		 233 aa  304  9.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2245  ABC transporter ATP-binding protein  65.95 
 
 		 233 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.310243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4778  high-affinity branched-chain amino acid transport protein of the ABC transporter ATP binding  62.07 
 
 		 233 aa  278  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000236786  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4010  ABC transporter related  63.95 
 
 		 233 aa  275  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  57.76 
 
 		 238 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5703  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.9 
 
 		 238 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3380  ABC transporter related  59.91 
 
 		 234 aa  259  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0950916 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1751  ABC transporter related  58.19 
 
 		 234 aa  258  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2726  ABC transporter related  59.48 
 
 		 235 aa  258  7e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.936769  normal  0.0467281 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1583  ABC transporter related  58.19 
 
 		 240 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457294  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1590  ABC transporter related  56.9 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0292  ABC transporter related  55.97 
 
 		 245 aa  238  4e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0163  ABC transporter related  53.75 
 
 		 255 aa  237  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4299  ABC transporter related  50.43 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  52.77 
 
 		 234 aa  221  7e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5448  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  49.77 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  47.23 
 
 		 236 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3187  ABC transporter related  49.35 
 
 		 238 aa  208  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.752623 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3734  ABC transporter related  49.13 
 
 		 238 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0518377  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4221  ABC transporter related  49.57 
 
 		 241 aa  206  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3479  ABC transporter related  48.48 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  46.22 
 
 		 237 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0652  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.05 
 
 		 238 aa  200  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.795922  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0614  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.11 
 
 		 238 aa  200  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  43.88 
 
 		 236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  44.64 
 
 		 236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  45.06 
 
 		 232 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  47.06 
 
 		 237 aa  195  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0081  ABC transporter related  47.01 
 
 		 237 aa  195  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1181  ABC transporter related  47.41 
 
 		 237 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  47.98 
 
 		 230 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  45.98 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  44.4 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4606  ABC transporter related  47.03 
 
 		 235 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  43.83 
 
 		 235 aa  192  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2774  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  47.47 
 
 		 233 aa  191  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2189  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.84 
 
 		 230 aa  191  9e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113026 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2274  ABC transporter related  46.98 
 
 		 237 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631731  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  43.97 
 
 		 233 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5099  ABC transporter related  46.22 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.999414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  43.97 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  43.97 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  42.92 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0083  ABC transporter related  44.87 
 
 		 233 aa  188  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.39 
 
 		 230 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3935  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.29 
 
 		 230 aa  189  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1400  ABC transporter related  44 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  45.57 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.49 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2365  ABC transporter related  44.3 
 
 		 235 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1515  ABC transporter related  44.21 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.274382  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  46.46 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  43.75 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  45.57 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  45.5 
 
 		 237 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  45.5 
 
 		 237 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1099  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.06 
 
 		 231 aa  185  6e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.810395  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  43.3 
 
 		 240 aa  184  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  47.44 
 
 		 230 aa  184  8e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  46.22 
 
 		 237 aa  184  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2037  ABC transporter ATP-binding protein  43.5 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  44.49 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1434  ABC transporter related  41.26 
 
 		 230 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2084  ABC transporter related  44.8 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0956  ABC transporter-related protein  42.41 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187154  normal  0.0788319 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1230  ABC transporter-related protein  46.33 
 
 		 238 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  47.81 
 
 		 239 aa  182  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0990  ABC transporter related  42.86 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.39491  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  42.74 
 
 		 237 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  44.77 
 
 		 238 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1385  ABC transporter related  43.58 
 
 		 251 aa  182  5.0000000000000004e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.692316  normal  0.0515657 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  44.83 
 
 		 233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.55 
 
 		 231 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0950  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.26 
 
 		 230 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2255  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.6 
 
 		 230 aa  181  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  41.81 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3321  ABC transporter related  42.45 
 
 		 249 aa  181  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  44.09 
 
 		 231 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  44.09 
 
 		 231 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1988  ABC transporter related  44.2 
 
 		 236 aa  181  8.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4111  ABC transporter related  44.39 
 
 		 248 aa  180  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3687  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.26 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  42.31 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1743  ABC transporter related  42.48 
 
 		 258 aa  180  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3170  ABC transporter-related protein  44.3 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  44.84 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  42.36 
 
 		 237 aa  179  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4047  ABC transporter related  43.93 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  44.35 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0210  ABC transporter related  44.91 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  44.35 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  42.08 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  46.85 
 
 		 484 aa  180  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0475  ABC transporter related  44.64 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  44.3 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5433  ABC transporter related  42.86 
 
 		 258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3649  ABC transporter-related protein  44.35 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  43.75 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>