More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2461 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 662 aa  1346    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  45.85 
 
 		 676 aa  557  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  37.37 
 
 		 715 aa  405  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  36.91 
 
 		 678 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0777  TonB-dependent receptor plug  38.63 
 
 		 645 aa  386  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  35.99 
 
 		 680 aa  378  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  37.09 
 
 		 615 aa  343  5e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  34.69 
 
 		 642 aa  322  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 710 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  28.13 
 
 		 687 aa  218  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  26.54 
 
 		 718 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3833  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  27.8 
 
 		 667 aa  153  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 643 aa  138  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 714 aa  130  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 705 aa  120  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  39.44 
 
 		 670 aa  120  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 680 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  24.53 
 
 		 652 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 679 aa  115  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 613 aa  115  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 671 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 699 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  24.61 
 
 		 641 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  26.53 
 
 		 684 aa  109  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2036  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 687 aa  107  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 681 aa  101  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3661  hypothetical protein  36 
 
 		 702 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0552  TonB-dependent receptor, plug  32.98 
 
 		 653 aa  100  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43650  hypothetical protein  34.55 
 
 		 705 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00638923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3494  TonB-dependent receptor plug  32.39 
 
 		 715 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3845  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 696 aa  99.8  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3742  TonB-dependent receptor plug  31.6 
 
 		 715 aa  97.1  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  24.64 
 
 		 665 aa  96.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 707 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1697  TonB-dependent receptor, plug  35.68 
 
 		 704 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4171  hypothetical protein  40 
 
 		 704 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  23.32 
 
 		 650 aa  94.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  22.79 
 
 		 656 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3002  TonB-dependent receptor plug  24.09 
 
 		 668 aa  92.8  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.957092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  22.27 
 
 		 659 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0104  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 678 aa  92.8  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479806  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  23 
 
 		 650 aa  92.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  23.24 
 
 		 656 aa  91.7  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  22.54 
 
 		 650 aa  90.9  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  22.54 
 
 		 650 aa  90.9  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  22.54 
 
 		 650 aa  90.9  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  22.14 
 
 		 663 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  22.14 
 
 		 663 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 642 aa  90.1  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  22.14 
 
 		 663 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  22.14 
 
 		 663 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  22.14 
 
 		 663 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  22.14 
 
 		 663 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4645  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 693 aa  89.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318415 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  21.67 
 
 		 641 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3634  TonB-dependent receptor, plug  22.71 
 
 		 668 aa  89  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  23.44 
 
 		 646 aa  87.8  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2952  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 645 aa  87  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  25.28 
 
 		 640 aa  86.3  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 653 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  25.14 
 
 		 572 aa  85.9  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  33.18 
 
 		 710 aa  85.5  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 649 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  23.92 
 
 		 665 aa  84.3  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  23.92 
 
 		 665 aa  84.3  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  23.92 
 
 		 665 aa  84.3  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 649 aa  84  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 635 aa  84  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  32.16 
 
 		 673 aa  83.6  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0123  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 670 aa  83.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  24.24 
 
 		 666 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3850  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 671 aa  82.4  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.302325  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 893 aa  82  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 649 aa  82  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 681 aa  82  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  23.45 
 
 		 680 aa  81.6  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 640 aa  81.6  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 653 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  24.24 
 
 		 666 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  35.48 
 
 		 682 aa  81.3  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  24.24 
 
 		 666 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 634 aa  80.9  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2789  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 675 aa  80.9  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  31.9 
 
 		 618 aa  80.9  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 662 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2900  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  32.56 
 
 		 686 aa  80.9  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 794 aa  80.5  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 662 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1006  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 426 aa  79.7  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.711145  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5117  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 801 aa  80.1  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  29.91 
 
 		 659 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1992  TonB-dependent receptor, plug  33.14 
 
 		 671 aa  80.5  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.643758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  37.72 
 
 		 692 aa  79.7  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1229  TonB-dependent receptor plug  35.03 
 
 		 662 aa  79.3  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 665 aa  79.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  22.97 
 
 		 634 aa  79  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  34.91 
 
 		 1023 aa  79  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 680 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 662 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 616 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>