More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1370 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1370  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 
335 aa  671    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.35 
 
 
750 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129426  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2766  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.27 
 
 
717 aa  110  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.947572  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1737  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.75 
 
 
720 aa  106  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1934  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.43 
 
 
720 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668168  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2523  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.33 
 
 
1194 aa  99.8  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0842  sensory box histidine kinase/response regulator  27.96 
 
 
787 aa  99  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220519  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1701  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 
571 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0239416  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  26.97 
 
 
1268 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0700  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.36 
 
 
1419 aa  97.8  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.81616  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.36 
 
 
981 aa  96.3  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.5 
 
 
1113 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0672  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.82 
 
 
770 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2521  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.33 
 
 
571 aa  94.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0595753 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.62 
 
 
749 aa  94.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.116264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3740  putative PAS/PAC sensor protein  28.82 
 
 
1109 aa  94.4  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2731  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.37 
 
 
1007 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0685  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.64 
 
 
770 aa  93.6  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000495863 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.09 
 
 
814 aa  92  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2401  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 
991 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2707  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.52 
 
 
776 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.8 
 
 
1108 aa  89.7  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1192  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.71 
 
 
912 aa  89.7  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.98 
 
 
822 aa  87.8  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 
642 aa  87  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5814  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.39 
 
 
583 aa  87  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.552615  normal  0.0161436 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.74 
 
 
953 aa  86.3  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.42 
 
 
1342 aa  85.5  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.14 
 
 
1309 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.28 
 
 
785 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.4 
 
 
664 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.72 
 
 
654 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2824  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.37 
 
 
1018 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0209449 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0366  sensor histidine kinase/response regulator  23.22 
 
 
742 aa  83.2  0.000000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0716  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.73 
 
 
890 aa  83.2  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.68 
 
 
661 aa  82.8  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1486  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.38 
 
 
886 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4481  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.36 
 
 
737 aa  81.6  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.913087  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2764  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.3 
 
 
1275 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0647988  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  27.8 
 
 
766 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.8 
 
 
770 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.76 
 
 
663 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.25 
 
 
983 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0936  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.41 
 
 
803 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 
727 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.56 
 
 
874 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.18 
 
 
860 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1787  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.54 
 
 
931 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0232  sensor histidine kinase  26.27 
 
 
716 aa  80.5  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786809  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.18 
 
 
1509 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2019  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.46 
 
 
1016 aa  80.5  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.25506  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0536  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.14 
 
 
531 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.77 
 
 
642 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  23.64 
 
 
727 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.33 
 
 
1338 aa  79.7  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216357  normal  0.0407933 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0550  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.59 
 
 
540 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0519596 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2375  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.84 
 
 
766 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.88 
 
 
677 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1102  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.73 
 
 
823 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.813916  normal  0.354207 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.8 
 
 
795 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0114838  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0853  sensor histidine kinase/reponse regulator  26.58 
 
 
845 aa  77.8  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00134282  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2709  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 
812 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.601691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0486  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.58 
 
 
837 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000590544 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.14 
 
 
853 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.74 
 
 
642 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1443  sensor histidine kinase/response regulator  24.37 
 
 
654 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.676986  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2333  histidine kinase  31.1 
 
 
538 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 
886 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.25 
 
 
897 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.98 
 
 
837 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.3 
 
 
889 aa  75.9  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.81 
 
 
846 aa  75.1  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118602  normal  0.0390699 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  24.42 
 
 
824 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0313  response regulator receiver protein  31.46 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.58 
 
 
673 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0541  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  29.23 
 
 
575 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  35.25 
 
 
1561 aa  74.3  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.88 
 
 
641 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  26.3 
 
 
892 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1727  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.76 
 
 
793 aa  73.9  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.72 
 
 
645 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  23 
 
 
727 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1840  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.14 
 
 
482 aa  73.9  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.366501 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1929  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  23.43 
 
 
853 aa  73.9  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2252  GAF sensor hybrid histidine kinase  24.12 
 
 
732 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535804  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1985  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.8 
 
 
650 aa  72.8  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 
1260 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.37 
 
 
1047 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1796  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 
871 aa  72.8  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183002  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2378  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.52 
 
 
551 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.81922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0052  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.63 
 
 
1054 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5234  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
946 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.43 
 
 
1322 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.62 
 
 
864 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  25.75 
 
 
912 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.62 
 
 
741 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.74 
 
 
1260 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0848  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.15 
 
 
698 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.132769  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1243  histidine kinase  23.96 
 
 
654 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0706231 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0933  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 
760 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>