More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0207 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  46.82 
 
 		 895 aa  726    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  47.93 
 
 		 1059 aa  771    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  43.9 
 
 		 850 aa  704    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  48.12 
 
 		 1063 aa  769    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  48.81 
 
 		 852 aa  800    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  48.24 
 
 		 1063 aa  771    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  46.84 
 
 		 1057 aa  761    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  47.3 
 
 		 895 aa  741    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  45.7 
 
 		 868 aa  703    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  46.23 
 
 		 853 aa  751    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  47.7 
 
 		 1074 aa  766    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  46.99 
 
 		 892 aa  740    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  46.1 
 
 		 923 aa  738    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  71.64 
 
 		 890 aa  1147    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  50.55 
 
 		 730 aa  727    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  62.71 
 
 		 910 aa  1064    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  46.82 
 
 		 895 aa  734    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  45.06 
 
 		 853 aa  749    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  47.18 
 
 		 895 aa  738    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  52.02 
 
 		 847 aa  692    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  48.24 
 
 		 1063 aa  771    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  45.52 
 
 		 853 aa  734    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 855 aa  1769    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  47.15 
 
 		 1057 aa  762    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  46.91 
 
 		 891 aa  719    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  41.97 
 
 		 957 aa  632  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  41.59 
 
 		 850 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  41.59 
 
 		 850 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  41.36 
 
 		 850 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  40.05 
 
 		 843 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  40.28 
 
 		 869 aa  554  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  39.15 
 
 		 840 aa  549  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  39.02 
 
 		 843 aa  545  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  38.59 
 
 		 875 aa  529  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  37.92 
 
 		 871 aa  531  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  35.57 
 
 		 835 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  35.06 
 
 		 843 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  34.19 
 
 		 958 aa  428  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  33.96 
 
 		 846 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  34.56 
 
 		 845 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  34.48 
 
 		 975 aa  418  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  33.6 
 
 		 845 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  35.17 
 
 		 886 aa  411  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0636  Rhs element Vgr protein  32.22 
 
 		 912 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6904  Rhs element Vgr protein  33.02 
 
 		 928 aa  406  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4173  type VI secretion system Vgr family protein  34.29 
 
 		 784 aa  406  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  33.94 
 
 		 901 aa  405  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  33.77 
 
 		 837 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  33.41 
 
 		 920 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  33.37 
 
 		 885 aa  395  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2142  Rhs element Vgr protein  31.63 
 
 		 961 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  32.94 
 
 		 918 aa  389  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0933  Rhs element Vgr protein, putative  32.19 
 
 		 780 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218046  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1531  Rhs element Vgr protein, putative  32.06 
 
 		 780 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.398232  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  32.25 
 
 		 834 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  32.69 
 
 		 968 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  32.25 
 
 		 834 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  32.25 
 
 		 834 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2595  Rhs element Vgr protein  32.42 
 
 		 912 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.43186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  32.15 
 
 		 851 aa  360  6e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  32.39 
 
 		 853 aa  360  7e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  31.67 
 
 		 952 aa  352  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1944  putative VGR-related protein  31.87 
 
 		 865 aa  351  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.463314 
 
 
-
 
NC_003296  RS03020  putative VGR-related protein  31.06 
 
 		 885 aa  351  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.318268 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6610  type VI secretion system Vgr family protein  32.9 
 
 		 924 aa  349  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  31.59 
 
 		 826 aa  346  8e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  32.33 
 
 		 889 aa  346  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  32.61 
 
 		 1284 aa  346  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0958  putative VGR-related protein  31.5 
 
 		 907 aa  343  8e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  37.13 
 
 		 661 aa  337  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  37.84 
 
 		 703 aa  337  7e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  37.48 
 
 		 661 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  37.48 
 
 		 661 aa  335  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  37.48 
 
 		 661 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  37.48 
 
 		 661 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  37.48 
 
 		 661 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  38.18 
 
 		 661 aa  335  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  37.28 
 
 		 661 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  31.77 
 
 		 1284 aa  333  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  31.87 
 
 		 906 aa  327  9e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  36.28 
 
 		 618 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  31.71 
 
 		 822 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  31.54 
 
 		 906 aa  321  3.9999999999999996e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  36.16 
 
 		 614 aa  317  7e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  35.22 
 
 		 616 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  30.05 
 
 		 941 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  35.37 
 
 		 613 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  36.11 
 
 		 618 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  27.95 
 
 		 933 aa  286  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  29.52 
 
 		 955 aa  283  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  29.6 
 
 		 918 aa  279  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  29.89 
 
 		 898 aa  279  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6418  Rhs element Vgr protein  28.89 
 
 		 956 aa  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.149183 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1411  Rhs element Vgr protein  28.89 
 
 		 956 aa  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  33.27 
 
 		 683 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  33.33 
 
 		 646 aa  270  8e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  36.05 
 
 		 734 aa  270  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  32.85 
 
 		 741 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  36.59 
 
 		 734 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  36.59 
 
 		 734 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>