More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1797 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5188  MscS mechanosensitive ion channel  92.31 
 
 		 390 aa  661    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1386  MscS mechanosensitive ion channel  90.26 
 
 		 391 aa  695    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6191  MscS mechanosensitive ion channel  94.87 
 
 		 390 aa  684    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.593763  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1825  MscS mechanosensitive ion channel  99.74 
 
 		 390 aa  771    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0903923  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1888  MscS mechanosensitive ion channel  94.87 
 
 		 390 aa  684    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1911  MscS mechanosensitive ion channel  94.87 
 
 		 390 aa  684    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801877 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1797  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 390 aa  773    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986921 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2160  mechanosensitive ion channel family protein  76.04 
 
 		 394 aa  549  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2257  small-conductance mechanosensitive ion channel  70.1 
 
 		 407 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0990371  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2275  mechanosensitive ion channel family protein  76.62 
 
 		 395 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1910  mechanosensitive ion channel family protein  76.36 
 
 		 395 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2314  mechanosensitive ion channel family protein  76.36 
 
 		 395 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1419  mechanosensitive ion channel family protein  76.36 
 
 		 395 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2436  mechanosensitive ion channel family protein  76.36 
 
 		 395 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1183  mechanosensitive ion channel family protein  76.36 
 
 		 395 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3394  mechanosensitive ion channel family protein  76.36 
 
 		 395 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1945  MscS Mechanosensitive ion channel  68.56 
 
 		 407 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.454872 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4345  MscS mechanosensitive ion channel  53.56 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3568  MscS Mechanosensitive ion channel  51.16 
 
 		 353 aa  362  8e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.492229  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2062  MscS mechanosensitive ion channel  52.31 
 
 		 352 aa  355  5.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1241  mechanosensitive ion channel family protein  55.66 
 
 		 362 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5044  mechanosensitive ion channel protein  50.3 
 
 		 357 aa  351  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2275  MscS mechanosensitive ion channel  53.75 
 
 		 376 aa  348  7e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.312032  normal  0.0129381 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0636  MscS mechanosensitive ion channel  55.38 
 
 		 364 aa  339  5e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3570  MscS mechanosensitive ion channel  51.71 
 
 		 368 aa  326  5e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02550  membrane protein  50.31 
 
 		 375 aa  315  9e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.290793  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0785  MscS Mechanosensitive ion channel  53.98 
 
 		 395 aa  303  5.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0017606  normal  0.0299135 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1933  MscS Mechanosensitive ion channel  47.27 
 
 		 358 aa  300  2e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1009  small-conductance mechanosensitive channel  54.01 
 
 		 331 aa  297  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2855  MscS mechanosensitive ion channel  52.96 
 
 		 374 aa  285  8e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154936 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2136  MscS Mechanosensitive ion channel  52.71 
 
 		 349 aa  280  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3905  MscS mechanosensitive ion channel  54.22 
 
 		 373 aa  279  6e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2114  MscS Mechanosensitive ion channel  40.28 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2268  MscS mechanosensitive ion channel  49.04 
 
 		 362 aa  277  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.528739  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0838  MscS Mechanosensitive ion channel  50.97 
 
 		 374 aa  271  2e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0235  MscS mechanosensitive ion channel  57.39 
 
 		 368 aa  264  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1121  MscS mechanosensitive ion channel  43.44 
 
 		 374 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3654  MscS mechanosensitive ion channel  52 
 
 		 393 aa  260  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0415  small-conductance mechanosensitive channel  44.03 
 
 		 371 aa  261  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.344204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3940  MscS Mechanosensitive ion channel  49.62 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3947  MscS Mechanosensitive ion channel  52 
 
 		 393 aa  259  6e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0285178  normal  0.460909 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0292  hypothetical protein  48.05 
 
 		 360 aa  257  3e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.40096  hitchhiker  0.00233312 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33880  small-conductance mechanosensitive channel  50.61 
 
 		 727 aa  251  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415466  normal  0.49587 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2539  MscS Mechanosensitive ion channel  46.3 
 
 		 360 aa  249  8e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.984511  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3749  Small-conductance mechanosensitive ion channel  39.39 
 
 		 380 aa  249  9e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0247  hypothetical protein  45.14 
 
 		 361 aa  248  2e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  44.98 
 
 		 359 aa  245  8e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0017  MscS Mechanosensitive ion channel  38.36 
 
 		 392 aa  244  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.305748 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3703  MscS mechanosensitive ion channel  49.59 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0936689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0914  MscS mechanosensitive ion channel  44.57 
 
 		 411 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1771  MscS mechanosensitive ion channel  39.02 
 
 		 400 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0118  MscS Mechanosensitive ion channel  47.64 
 
 		 358 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.472344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6211  MscS Mechanosensitive ion channel  41.83 
 
 		 391 aa  239  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3972  MscS Mechanosensitive ion channel  36.86 
 
 		 363 aa  239  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0682489  normal  0.528998 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1046  MscS mechanosensitive ion channel  46.99 
 
 		 398 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1758  MscS mechanosensitive ion channel  40.28 
 
 		 399 aa  236  6e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2022  small-conductance mechanosensitive channel  40.86 
 
 		 379 aa  234  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6267  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  46.85 
 
 		 365 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2302  MscS mechanosensitive ion channel  47.91 
 
 		 399 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.47196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2263  MscS mechanosensitive ion channel  47.91 
 
 		 402 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2310  MscS mechanosensitive ion channel  47.91 
 
 		 399 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5784  MscS mechanosensitive ion channel  45.48 
 
 		 394 aa  229  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0178  MscS mechanosensitive ion channel  46.85 
 
 		 545 aa  228  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.760917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5934  MscS Mechanosensitive ion channel  38.73 
 
 		 378 aa  227  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6897  MscS mechanosensitive ion channel  41.77 
 
 		 492 aa  225  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2161  MscS Mechanosensitive ion channel  47.18 
 
 		 365 aa  223  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10518  MscS Mechanosensitive ion channel  35.82 
 
 		 591 aa  213  5.999999999999999e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526339  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1861  MscS Mechanosensitive ion channel  39.33 
 
 		 402 aa  209  6e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3015  MscS Mechanosensitive ion channel  41.41 
 
 		 379 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1203  MscS Mechanosensitive ion channel  46 
 
 		 372 aa  186  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.950573  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1004  MscS mechanosensitive ion channel  32.7 
 
 		 648 aa  163  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1262  MscS mechanosensitive ion channel  31.54 
 
 		 627 aa  158  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.523793  normal  0.0747451 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0783  MscS mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 571 aa  113  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  25.71 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2527  MscS mechanosensitive ion channel  30.96 
 
 		 566 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.145786 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  25.39 
 
 		 268 aa  95.9  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 308 aa  94.4  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  28.37 
 
 		 351 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  26.9 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  32.03 
 
 		 278 aa  75.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0014  MscS Mechanosensitive ion channel  24.56 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  28.64 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  24.73 
 
 		 305 aa  66.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  24.71 
 
 		 806 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  28.96 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  32 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  29.34 
 
 		 321 aa  62.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3397  MscS mechanosensitive ion channel  24.49 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  30.06 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  24.71 
 
 		 305 aa  62  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5329  mechanosensitive ion channel protein MscS  30.97 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  24.45 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  27.85 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  25.3 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2989  Ricin B lectin  30 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000129425 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  23.67 
 
 		 484 aa  60.5  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0308  MscS mechanosensitive ion channel  26.09 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  33.07 
 
 		 300 aa  59.3  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4142  MscS mechanosensitive ion channel  21.21 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.93898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>