199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3996 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  100 
 
 		 438 aa  847    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3775  major facilitator superfamily MFS_1  67.79 
 
 		 425 aa  504  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0255  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 440 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  50.84 
 
 		 423 aa  330  3e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  46.35 
 
 		 435 aa  324  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6833  transporter, major facilitator superfamily  48.91 
 
 		 423 aa  312  5.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3224  major facilitator superfamily MFS_1  47.46 
 
 		 433 aa  294  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  37.77 
 
 		 423 aa  243  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1439  major facilitator superfamily MFS_1  38.69 
 
 		 426 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0835777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 		 425 aa  212  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0806  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 419 aa  210  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  37.36 
 
 		 426 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2779  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 443 aa  179  9e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.617635  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  33.77 
 
 		 428 aa  176  7e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  35.47 
 
 		 421 aa  175  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 415 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2534  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 		 446 aa  159  9e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4387  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 		 429 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  34.29 
 
 		 419 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1836  major facilitator transporter  31 
 
 		 440 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.860837  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2528  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 451 aa  146  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  31.06 
 
 		 416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  34.42 
 
 		 424 aa  130  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 		 407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 404 aa  97.1  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0506  putative permease  31.75 
 
 		 210 aa  95.9  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1832  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  30.34 
 
 		 353 aa  94.4  4e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1330  Na+/sugar symporter  26.6 
 
 		 545 aa  76.3  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0921  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  27.09 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 510 aa  60.5  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  32.54 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.95 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0616  major facilitator superfamily MFS_1  23.43 
 
 		 443 aa  57  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0461422  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11931  sialic acid transport integral membrane protein nanT  26.27 
 
 		 422 aa  57  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 401 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  32.8 
 
 		 505 aa  57  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  27.13 
 
 		 507 aa  55.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 503 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 501 aa  55.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2559  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 407 aa  55.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 412 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 388 aa  54.3  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 518 aa  54.3  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 		 457 aa  54.3  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 530 aa  53.5  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 502 aa  53.9  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1388  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 		 403 aa  53.9  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012215  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 399 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  24.58 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  25.16 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 531 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 		 397 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  27.46 
 
 		 418 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  26.81 
 
 		 498 aa  51.6  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 502 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  34.27 
 
 		 514 aa  51.6  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  33.61 
 
 		 453 aa  51.2  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 551 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 531 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 551 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 551 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 551 aa  51.2  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 551 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 531 aa  50.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 519 aa  50.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  27.41 
 
 		 493 aa  50.4  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45818  predicted protein  27.7 
 
 		 583 aa  50.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0729495  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0952  General substrate transporter  28.98 
 
 		 430 aa  50.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 403 aa  50.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  26.36 
 
 		 529 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  24.37 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  25.94 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 		 457 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2529  hypothetical protein  25.67 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  25.61 
 
 		 394 aa  48.9  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 433 aa  48.5  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 460 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  32.94 
 
 		 501 aa  48.5  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 524 aa  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  20.86 
 
 		 485 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  20.86 
 
 		 485 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  20.86 
 
 		 485 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  26.25 
 
 		 421 aa  47.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4579  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 487 aa  47.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  20.86 
 
 		 485 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 		 490 aa  47.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  31.31 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4082  General substrate transporter  25.13 
 
 		 465 aa  47.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>