More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0914 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0914  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 411 aa  817    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33880  small-conductance mechanosensitive channel  57.41 
 
 		 727 aa  363  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415466  normal  0.49587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6897  MscS mechanosensitive ion channel  50.61 
 
 		 492 aa  346  4e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1046  MscS mechanosensitive ion channel  48.82 
 
 		 398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0178  MscS mechanosensitive ion channel  59.19 
 
 		 545 aa  329  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.760917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2263  MscS mechanosensitive ion channel  46.49 
 
 		 402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2302  MscS mechanosensitive ion channel  46.49 
 
 		 399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.47196 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2310  MscS mechanosensitive ion channel  46.49 
 
 		 399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1758  MscS mechanosensitive ion channel  46.9 
 
 		 399 aa  323  5e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5784  MscS mechanosensitive ion channel  48.2 
 
 		 394 aa  319  6e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1771  MscS mechanosensitive ion channel  46.13 
 
 		 400 aa  319  7e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6211  MscS Mechanosensitive ion channel  48.36 
 
 		 391 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0785  MscS Mechanosensitive ion channel  44.57 
 
 		 395 aa  268  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0017606  normal  0.0299135 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1933  MscS Mechanosensitive ion channel  41.23 
 
 		 358 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1203  MscS Mechanosensitive ion channel  51.23 
 
 		 372 aa  263  4e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.950573  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6267  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  50.95 
 
 		 365 aa  262  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  47.06 
 
 		 359 aa  260  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1009  small-conductance mechanosensitive channel  48.45 
 
 		 331 aa  260  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5044  mechanosensitive ion channel protein  43 
 
 		 357 aa  260  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02550  membrane protein  42.44 
 
 		 375 aa  260  4e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.290793  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0415  small-conductance mechanosensitive channel  41.96 
 
 		 371 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.344204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2114  MscS Mechanosensitive ion channel  39.18 
 
 		 361 aa  257  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4345  MscS mechanosensitive ion channel  42.72 
 
 		 361 aa  257  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2022  small-conductance mechanosensitive channel  41.16 
 
 		 379 aa  256  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3015  MscS Mechanosensitive ion channel  46.15 
 
 		 379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2062  MscS mechanosensitive ion channel  44.12 
 
 		 352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2136  MscS Mechanosensitive ion channel  47.67 
 
 		 349 aa  250  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0292  hypothetical protein  44.22 
 
 		 360 aa  249  5e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.40096  hitchhiker  0.00233312 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3568  MscS Mechanosensitive ion channel  40.23 
 
 		 353 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.492229  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2268  MscS mechanosensitive ion channel  45.98 
 
 		 362 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.528739  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2275  MscS mechanosensitive ion channel  40.62 
 
 		 376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.312032  normal  0.0129381 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1386  MscS mechanosensitive ion channel  43 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5188  MscS mechanosensitive ion channel  44.85 
 
 		 390 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1911  MscS mechanosensitive ion channel  44.65 
 
 		 390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801877 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6191  MscS mechanosensitive ion channel  44.65 
 
 		 390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.593763  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1888  MscS mechanosensitive ion channel  44.65 
 
 		 390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3940  MscS Mechanosensitive ion channel  41.14 
 
 		 393 aa  243  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3654  MscS mechanosensitive ion channel  39.69 
 
 		 393 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1797  MscS mechanosensitive ion channel  44.85 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986921 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3947  MscS Mechanosensitive ion channel  39.69 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0285178  normal  0.460909 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0118  MscS Mechanosensitive ion channel  47.1 
 
 		 358 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.472344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2161  MscS Mechanosensitive ion channel  38.5 
 
 		 365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2160  mechanosensitive ion channel family protein  44.29 
 
 		 394 aa  240  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1121  MscS mechanosensitive ion channel  44.07 
 
 		 374 aa  239  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1825  MscS mechanosensitive ion channel  44.49 
 
 		 390 aa  239  8e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0903923  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1241  mechanosensitive ion channel family protein  40.71 
 
 		 362 aa  237  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1419  mechanosensitive ion channel family protein  44.49 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2275  mechanosensitive ion channel family protein  44.49 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2436  mechanosensitive ion channel family protein  44.49 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2314  mechanosensitive ion channel family protein  44.49 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1183  mechanosensitive ion channel family protein  44.49 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3394  mechanosensitive ion channel family protein  44.49 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1910  mechanosensitive ion channel family protein  44.49 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0838  MscS Mechanosensitive ion channel  38.79 
 
 		 374 aa  237  3e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1945  MscS Mechanosensitive ion channel  45.53 
 
 		 407 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.454872 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2257  small-conductance mechanosensitive ion channel  45.53 
 
 		 407 aa  235  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0990371  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3749  Small-conductance mechanosensitive ion channel  37.74 
 
 		 380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2539  MscS Mechanosensitive ion channel  44.98 
 
 		 360 aa  234  3e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.984511  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3972  MscS Mechanosensitive ion channel  46.85 
 
 		 363 aa  233  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0682489  normal  0.528998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5934  MscS Mechanosensitive ion channel  38.41 
 
 		 378 aa  229  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2855  MscS mechanosensitive ion channel  41.58 
 
 		 374 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154936 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0247  hypothetical protein  43.13 
 
 		 361 aa  226  6e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3905  MscS mechanosensitive ion channel  40.41 
 
 		 373 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3703  MscS mechanosensitive ion channel  43.5 
 
 		 373 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0936689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0636  MscS mechanosensitive ion channel  41.63 
 
 		 364 aa  209  7e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3570  MscS mechanosensitive ion channel  41.25 
 
 		 368 aa  207  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0235  MscS mechanosensitive ion channel  39.25 
 
 		 368 aa  199  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0017  MscS Mechanosensitive ion channel  34.01 
 
 		 392 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.305748 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10518  MscS Mechanosensitive ion channel  29.91 
 
 		 591 aa  178  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526339  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1861  MscS Mechanosensitive ion channel  32.71 
 
 		 402 aa  149  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1262  MscS mechanosensitive ion channel  31.76 
 
 		 627 aa  130  6e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.523793  normal  0.0747451 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1004  MscS mechanosensitive ion channel  28.49 
 
 		 648 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0783  MscS mechanosensitive ion channel  26.25 
 
 		 571 aa  109  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2527  MscS mechanosensitive ion channel  27.65 
 
 		 566 aa  99  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.145786 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  28.11 
 
 		 268 aa  92.8  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  32.17 
 
 		 351 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  26.07 
 
 		 307 aa  89.7  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  27.83 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  26.12 
 
 		 278 aa  72.8  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  31.09 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  24.04 
 
 		 304 aa  66.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  30.86 
 
 		 321 aa  62  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  25.91 
 
 		 864 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 773 aa  59.7  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1729  MscS Mechanosensitive ion channel  25.3 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.356127  hitchhiker  0.00130809 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0014  MscS Mechanosensitive ion channel  24.84 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  24.35 
 
 		 322 aa  57  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13183  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  23.61 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1968  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  37 
 
 		 475 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  27.5 
 
 		 303 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  25.9 
 
 		 981 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  25.19 
 
 		 307 aa  55.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  29.52 
 
 		 806 aa  54.7  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0444  MscS Mechanosensitive ion channel  27.41 
 
 		 404 aa  55.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  25 
 
 		 633 aa  53.9  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  26.3 
 
 		 389 aa  53.9  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0181  MscS mechanosensitive ion channel  23.21 
 
 		 707 aa  53.9  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  32.28 
 
 		 305 aa  53.5  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  25 
 
 		 279 aa  53.5  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  28.81 
 
 		 310 aa  53.1  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>