More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3714 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 178 aa  338  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 202 aa  97.1  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  38.85 
 
 		 194 aa  97.1  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 191 aa  96.3  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 201 aa  95.9  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 203 aa  94.7  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 192 aa  94.4  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 224 aa  90.9  8e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 287 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 219 aa  90.5  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 204 aa  87.4  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 383 aa  87.4  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 210 aa  87  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  38.79 
 
 		 222 aa  87  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 199 aa  87  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  37.06 
 
 		 211 aa  86.3  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 199 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 194 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 194 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 223 aa  81.3  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  40.64 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  32.8 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 245 aa  78.2  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  34.13 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 205 aa  74.3  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  42.38 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  36.13 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3344  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 230 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  37.33 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  31.85 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  48.72 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 191 aa  64.3  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 191 aa  64.3  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  36.55 
 
 		 196 aa  62  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 213 aa  62  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  38.73 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
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NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  31.67 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
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NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  30.49 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
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