More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3447 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 175 aa  347  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  96.57 
 
 		 178 aa  335  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  96.57 
 
 		 178 aa  335  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  86.93 
 
 		 176 aa  303  6e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  31.69 
 
 		 216 aa  67.8  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0081  two component LuxR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  54.39 
 
 		 956 aa  64.7  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4080  transcriptional regulatory protein UhpA  40.4 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4132  two-component system response regulator  40.4 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  45.26 
 
 		 917 aa  63.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 924 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 950 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0986  LuxR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1093  response regulator  30.28 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.120555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  38.39 
 
 		 901 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3355  two component LuxR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1568  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 		 211 aa  62  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0132  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.401597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 235 aa  60.8  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3763  two component LuxR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 221 aa  60.8  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0403461 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11180  putative transcriptional regulator  47.14 
 
 		 222 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0312289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.53 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1080  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  54.24 
 
 		 823 aa  60.5  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.53 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0633  LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1389  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.744509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  51.79 
 
 		 904 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  47.83 
 
 		 959 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4648  two component LuxR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3096  regulatory protein, LuxR  46.38 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.735562  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  50.94 
 
 		 884 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  46.27 
 
 		 680 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  54.24 
 
 		 894 aa  59.3  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3302  LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0560  transcriptional regulator, LuxR family protein  44.93 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02261  LuxR family regulatory protein  47.46 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0250136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.45 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1980  two component LuxR family transcriptional regulator  59.62 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.893627  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0864  LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3200  LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.93 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3414  LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.295313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0644  LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140532  unclonable  0.00000001613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3579  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.393396  normal  0.0540104 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1520  LuxR transcriptional regulator  45.76 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0720  LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0333677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2497  two component LuxR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000315398  normal  0.0281112 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0896  LuxR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3194  LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0232917  normal  0.227391 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  47.46 
 
 		 337 aa  58.2  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3278  two component LuxR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0541  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.45 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3887  LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000207134 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1526  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.88337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1873  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.145213  normal  0.385799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  42.68 
 
 		 879 aa  58.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1234  LuxR family transcriptional regulator  56.9 
 
 		 856 aa  58.2  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1027  LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  48.28 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01100  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  45.45 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  58.82 
 
 		 903 aa  58.2  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0707  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.4 
 
 		 270 aa  57.8  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0851  DNA-binding response regulator  49.09 
 
 		 223 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464733  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1819  LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 339 aa  57.8  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0915  two component LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000299753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0998  response regulator  30.99 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01515  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  39.68 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.422594  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0974  two component LuxR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 309 aa  57.8  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.426964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 818 aa  57.8  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 227 aa  57.8  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3030  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3046  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.826568  normal  0.671191 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000091  transcriptional regulatory protein UhpA  46.38 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.136186  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.79 
 
 		 224 aa  57.8  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.77 
 
 		 225 aa  57.4  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7055  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 219 aa  57.4  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2665  transcriptional regulator, LuxR family  36.04 
 
 		 359 aa  57.4  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1314  transcriptional regulator, LuxR family  47.69 
 
 		 204 aa  57.4  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.96 
 
 		 217 aa  57.4  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0139  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  46.88 
 
 		 506 aa  57.8  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  50 
 
 		 964 aa  57.4  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1518.1  DNA-binding response regulator  49.06 
 
 		 223 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000399536  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3314  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.6 
 
 		 222 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00833126  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0560  DNA-binding response regulator  49.06 
 
 		 223 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0224831  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1236  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 208 aa  57  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.23752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  52.73 
 
 		 937 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3945  LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 221 aa  57  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00801334  normal  0.811932 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0875  LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 221 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0642  putative response regulator  41.89 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3137  response regulator receiver protein  43.06 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>