More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2807 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  59.89 
 
 		 727 aa  832    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  64.32 
 
 		 702 aa  862    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 713 aa  1427    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  48.67 
 
 		 727 aa  622  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  50.51 
 
 		 685 aa  590  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  48.17 
 
 		 719 aa  587  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  45.54 
 
 		 687 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  45.4 
 
 		 687 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  45.11 
 
 		 694 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  44.52 
 
 		 692 aa  519  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  44.68 
 
 		 694 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  44.44 
 
 		 742 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  44.01 
 
 		 724 aa  513  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  44.18 
 
 		 693 aa  515  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  43.87 
 
 		 677 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  43.56 
 
 		 681 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  43.34 
 
 		 680 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  44.73 
 
 		 677 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  42.62 
 
 		 685 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  42.66 
 
 		 682 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  44.65 
 
 		 681 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  44.65 
 
 		 681 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  44.33 
 
 		 698 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  43.97 
 
 		 725 aa  475  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  44.33 
 
 		 698 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  44.19 
 
 		 751 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  44.19 
 
 		 698 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  44.33 
 
 		 751 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  38.31 
 
 		 702 aa  399  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  34.92 
 
 		 730 aa  311  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 706 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  35.25 
 
 		 709 aa  305  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 821 aa  302  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  34.05 
 
 		 600 aa  300  4e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 734 aa  300  9e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  30.44 
 
 		 744 aa  297  4e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  34.99 
 
 		 693 aa  295  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  34.85 
 
 		 695 aa  293  9e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  32.23 
 
 		 689 aa  292  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  32.6 
 
 		 681 aa  288  2e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  32.45 
 
 		 681 aa  284  3.0000000000000004e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  31.18 
 
 		 758 aa  282  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  30.9 
 
 		 758 aa  280  7e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  31.24 
 
 		 758 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 835 aa  277  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  30.76 
 
 		 758 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 682 aa  276  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  32.7 
 
 		 705 aa  275  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 689 aa  273  6e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  31.9 
 
 		 758 aa  273  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  33.99 
 
 		 699 aa  272  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  34.13 
 
 		 714 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  33.29 
 
 		 707 aa  269  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  32.33 
 
 		 685 aa  268  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  29.44 
 
 		 801 aa  266  8.999999999999999e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 676 aa  266  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  34.34 
 
 		 705 aa  263  6e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  33.88 
 
 		 714 aa  251  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  31.04 
 
 		 702 aa  250  6e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 751 aa  249  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  33 
 
 		 719 aa  249  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  33.11 
 
 		 719 aa  249  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 797 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  31.23 
 
 		 723 aa  243  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  31.23 
 
 		 731 aa  243  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 709 aa  238  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 784 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 695 aa  236  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  31.56 
 
 		 774 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 784 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  27.98 
 
 		 744 aa  225  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 789 aa  225  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 783 aa  217  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  27.94 
 
 		 709 aa  217  7e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  27.28 
 
 		 778 aa  215  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  28.73 
 
 		 782 aa  214  5.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 733 aa  194  5e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 799 aa  187  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0270  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 766 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 759 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 763 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0594  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 708 aa  132  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.601286  hitchhiker  0.00250598 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0859  TonB-dependent receptor plug  39.01 
 
 		 249 aa  125  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.604475 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  33.86 
 
 		 836 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0069  iron-regulated outer membrane protein  35.21 
 
 		 868 aa  115  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024885  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1480  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 776 aa  109  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329669  normal  0.154283 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2339  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 797 aa  105  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.608898  normal  0.596694 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 732 aa  100  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 824 aa  81.3  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 730 aa  78.2  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  36.71 
 
 		 687 aa  76.6  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 801 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  25.5 
 
 		 650 aa  75.5  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1572  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 780 aa  73.9  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0693034  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 776 aa  72.4  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 698 aa  70.1  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  23.52 
 
 		 652 aa  69.3  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  30.7 
 
 		 737 aa  68.6  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  33.11 
 
 		 677 aa  68.6  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 727 aa  67  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>