More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003063 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003063  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 682 aa  1380    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2193  methyl-accepting chemotaxis protein  52.14 
 
 		 697 aa  656    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02788  hypothetical protein  83.72 
 
 		 698 aa  1125    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4190  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.77 
 
 		 688 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  35.88 
 
 		 714 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.91 
 
 		 688 aa  327  5e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.124474  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1228  methyl-accepting chemotaxis transducer  35.91 
 
 		 688 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  35.62 
 
 		 714 aa  323  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.23 
 
 		 688 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.39 
 
 		 714 aa  311  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  34.94 
 
 		 713 aa  311  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3770  chemotaxis sensory transducer  35.52 
 
 		 715 aa  306  7e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4382  chemotaxis sensory transducer  36.22 
 
 		 738 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.34 
 
 		 716 aa  303  8.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.2 
 
 		 714 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  35.2 
 
 		 714 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.75 
 
 		 714 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2074  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.85 
 
 		 714 aa  297  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  34.66 
 
 		 712 aa  294  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  33.67 
 
 		 712 aa  289  9e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2970  chemotaxis sensory transducer  35.68 
 
 		 712 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3827  methyl-accepting chemotaxis transducer  34.26 
 
 		 695 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221184 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1940  methyl-accepting chemotaxis transducer  35.65 
 
 		 716 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000108039 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4675  methyl-accepting chemotaxis protein  32.42 
 
 		 701 aa  266  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595763  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.31 
 
 		 705 aa  258  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.568622  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  35.93 
 
 		 623 aa  254  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1220  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.27 
 
 		 706 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1187  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.27 
 
 		 706 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.27 
 
 		 706 aa  252  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.942476 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  34.97 
 
 		 623 aa  251  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1951  methyl-accepting chemotaxis protein  33.1 
 
 		 720 aa  250  5e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1278  methyl-accepting chemotaxis protein  33.21 
 
 		 706 aa  249  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2635  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.7 
 
 		 706 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.993869 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2909  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.6 
 
 		 706 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.307732 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2991  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.21 
 
 		 706 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0750474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3088  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.48 
 
 		 706 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193815  hitchhiker  0.00820004 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.91 
 
 		 554 aa  243  6e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.36 
 
 		 558 aa  242  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.38 
 
 		 554 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.58 
 
 		 622 aa  241  5e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0911  chemotaxis sensory transducer  31.41 
 
 		 705 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000403524  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  41.11 
 
 		 554 aa  239  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.72 
 
 		 626 aa  239  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.11 
 
 		 554 aa  239  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  33.46 
 
 		 628 aa  239  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  32.07 
 
 		 639 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.34 
 
 		 637 aa  236  9e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01109  methyl-accepting chemotaxis protein  33.53 
 
 		 743 aa  236  9e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.566074  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3237  methyl-accepting chemotaxis protein  31.28 
 
 		 771 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.19 
 
 		 554 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0316  methyl-accepting chemotaxis protein  35.2 
 
 		 652 aa  236  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.02 
 
 		 568 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.27 
 
 		 554 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.67 
 
 		 554 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.67 
 
 		 554 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.02 
 
 		 554 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  43.9 
 
 		 554 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 		 554 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  40.27 
 
 		 554 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1450  methyl-accepting chemotaxis protein  30.97 
 
 		 706 aa  234  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571496  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.47 
 
 		 622 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.94 
 
 		 554 aa  234  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.6 
 
 		 554 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1066  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.71 
 
 		 705 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.94 
 
 		 554 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  33.27 
 
 		 629 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.64 
 
 		 554 aa  233  9e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.19 
 
 		 554 aa  232  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  32.9 
 
 		 629 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  34.87 
 
 		 622 aa  231  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.45 
 
 		 705 aa  231  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.43 
 
 		 707 aa  230  8e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.852924  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2220  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  33.11 
 
 		 646 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.071358  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1741  methyl-accepting chemotaxis protein  33.83 
 
 		 623 aa  228  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  33.96 
 
 		 626 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1091  chemotaxis sensory transducer  39.42 
 
 		 620 aa  228  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0174472  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1103  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.79 
 
 		 706 aa  229  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.540965  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.35 
 
 		 554 aa  228  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04784  histidine kinase  41.35 
 
 		 628 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.12 
 
 		 554 aa  228  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.72 
 
 		 554 aa  228  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.67 
 
 		 636 aa  228  3e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.46 
 
 		 636 aa  228  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01884  hypothetical protein  32.27 
 
 		 627 aa  228  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2448  methyl-accepting chemotaxis protein  34.37 
 
 		 646 aa  227  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.718596  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.5 
 
 		 627 aa  227  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  40.9 
 
 		 639 aa  226  7e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.27 
 
 		 555 aa  226  9e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.34 
 
 		 638 aa  223  6e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.4 
 
 		 630 aa  223  8e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  31.95 
 
 		 633 aa  223  8e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.4 
 
 		 630 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1061  methyl-accepting chemotaxis protein  32.65 
 
 		 626 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0906  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  32.52 
 
 		 626 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.4 
 
 		 630 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.4 
 
 		 630 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2050  methyl-accepting chemotaxis protein  32.28 
 
 		 704 aa  221  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.459277  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1022  methyl-accepting chemotaxis protein  32.36 
 
 		 628 aa  221  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.771007  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.71 
 
 		 628 aa  220  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  32.21 
 
 		 630 aa  220  7e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>