164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0714 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  100 
 
 
611 aa  1244    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  36.44 
 
 
569 aa  392  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  34.69 
 
 
616 aa  363  4e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  32.95 
 
 
621 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  32.01 
 
 
659 aa  289  8e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0177  hypothetical protein  29.12 
 
 
696 aa  289  9e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0025  hypothetical protein  29.69 
 
 
699 aa  276  7e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0132  hypothetical protein  29.69 
 
 
699 aa  276  7e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000387943 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0226  hypothetical protein  29.69 
 
 
699 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  28.89 
 
 
629 aa  252  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  28.67 
 
 
629 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  28.31 
 
 
631 aa  239  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  28.81 
 
 
630 aa  230  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.63 
 
 
595 aa  228  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.59 
 
 
608 aa  219  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6728  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.36 
 
 
657 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0167  hypothetical protein  32.67 
 
 
322 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0100015  hitchhiker  6.88403e-24 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  23.83 
 
 
747 aa  139  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1056  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.67 
 
 
566 aa  137  4e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000236301  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0914  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.27 
 
 
1043 aa  134  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4995  hypothetical protein  24.12 
 
 
893 aa  131  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.124549  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3127  hypothetical protein  21.45 
 
 
610 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1816  truncated type IV secretory pathway VirB4 component protein  26.5 
 
 
668 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0791  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.65 
 
 
815 aa  123  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1688  transfer complex protein  23 
 
 
663 aa  120  6e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.330287  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1287  Tn5252, Orf26  24.09 
 
 
776 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0163  hypothetical protein  28.77 
 
 
323 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427999  hitchhiker  1.86977e-20 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0179  membrane bound ATPase, putative  22.65 
 
 
955 aa  108  2e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1395  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.66 
 
 
616 aa  109  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0290868  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1505  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.12 
 
 
836 aa  105  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0609191  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  25.2 
 
 
815 aa  105  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  25.84 
 
 
809 aa  103  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2211  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.46 
 
 
618 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1502  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  20.9 
 
 
609 aa  98.2  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  26.23 
 
 
868 aa  98.6  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  22.48 
 
 
866 aa  96.3  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5435  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.37 
 
 
515 aa  95.1  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18940  hypothetical protein  23.12 
 
 
908 aa  95.5  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0727779 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  24.38 
 
 
847 aa  94.4  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  24.11 
 
 
690 aa  92.4  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0020  hypothetical protein  24.85 
 
 
865 aa  91.7  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0301  hypothetical protein  21.56 
 
 
818 aa  91.3  4e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0733022  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0805  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.79 
 
 
495 aa  90.5  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  24.09 
 
 
827 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3176  conjugation protein  20.47 
 
 
1085 aa  90.1  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  25.67 
 
 
864 aa  89.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0034  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  23.63 
 
 
711 aa  86.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0565  hypothetical protein  20.79 
 
 
945 aa  85.5  0.000000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2753  hypothetical protein  19.3 
 
 
610 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  26.29 
 
 
864 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  24.48 
 
 
874 aa  84  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  23.82 
 
 
815 aa  84  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7298  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.65 
 
 
696 aa  84  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  0.0433123 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0253  sex pilus assembly protein  23.53 
 
 
815 aa  82.8  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2964  transfer complex protein  22.06 
 
 
711 aa  80.5  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0028  hypothetical protein  23.81 
 
 
858 aa  80.1  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0798103  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0029  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  25.23 
 
 
875 aa  77  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1089  type-IV secretion system protein TraC  21.69 
 
 
866 aa  76.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6919  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.92 
 
 
792 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5240  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like  21.66 
 
 
779 aa  74.7  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06770  hypothetical protein  20.39 
 
 
495 aa  72.4  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00150  hypothetical protein  20.24 
 
 
495 aa  72.8  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5522  hypothetical protein  22.84 
 
 
516 aa  72.8  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349353  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1342  ATP-binding protein  21.84 
 
 
461 aa  72  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8941  hypothetical protein  22.35 
 
 
505 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57395  normal  0.334134 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1535  hypothetical protein  21.68 
 
 
860 aa  68.6  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.324807 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0231  hypothetical protein  20.43 
 
 
846 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0444  hypothetical protein  19.09 
 
 
509 aa  65.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  19.45 
 
 
803 aa  63.9  0.000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2948  Type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TRAC  22.64 
 
 
841 aa  63.9  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0518  Type IV secretory pathway VirB4 protein  23.44 
 
 
845 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832849  normal  0.194578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3545  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.81 
 
 
811 aa  62  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0653304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4357  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.81 
 
 
819 aa  62.4  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.471619  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2320  hypothetical protein  21.61 
 
 
855 aa  61.2  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121695  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3057  AAA ATPase  21.92 
 
 
816 aa  60.8  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8472  hypothetical protein  21.91 
 
 
830 aa  60.1  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547779  normal  0.957952 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2653  hypothetical protein  21.55 
 
 
855 aa  59.3  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.696195  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06480  type IV secretory pathway VirB4 component-like protein  24.72 
 
 
500 aa  59.3  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132231  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3253  type IV secretory pathway VirB4 components-like  20.04 
 
 
861 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2908  conjugal transfer ATPase TrbE  20.7 
 
 
811 aa  58.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380632  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1756  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  23.43 
 
 
830 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0505  type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TraC  22.5 
 
 
843 aa  58.2  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  20.26 
 
 
839 aa  58.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0008  hypothetical protein  23.46 
 
 
644 aa  58.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.263896  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6709  hypothetical protein  21.74 
 
 
845 aa  57.4  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.534859  normal  0.161214 
 
 
-
 
NC_002950  PG1481  conjugative transposon protein TraG  21.75 
 
 
841 aa  56.6  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.612602 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0008  ATPase  27.53 
 
 
645 aa  56.6  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1553  conjugal transfer ATPase TrbE  20.4 
 
 
809 aa  56.6  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215631  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0205  AAA ATPase  21.58 
 
 
385 aa  56.6  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.519462  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8298  hypothetical protein  20.35 
 
 
575 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0435  conjugal transfer ATPase TrbE  20.23 
 
 
817 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  20.67 
 
 
800 aa  55.5  0.000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4851  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.25 
 
 
826 aa  54.7  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3315  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.25 
 
 
826 aa  54.7  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0533  type IV secretion system ATPase VirB4  19.9 
 
 
800 aa  53.9  0.000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4200  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.19 
 
 
826 aa  53.9  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.985629 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2648  conjugal transfer ATPase TrbE  20.72 
 
 
825 aa  53.9  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.947837  normal  0.965174 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2655  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  21.82 
 
 
822 aa  53.5  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1898  conjugal transfer ATPase TrbE  20.07 
 
 
817 aa  53.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3703  conjugal transfer ATPase TrbE  20.07 
 
 
817 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>