More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3041 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 1043 aa  2040    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  52.03 
 
 		 767 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1488  hemolysin-type calcium-binding region  46.68 
 
 		 854 aa  356  2e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  33.9 
 
 		 589 aa  240  9e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  45.17 
 
 		 946 aa  239  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  42.33 
 
 		 1279 aa  212  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  35.41 
 
 		 1400 aa  211  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  34.56 
 
 		 561 aa  211  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  39.34 
 
 		 2954 aa  206  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  42.07 
 
 		 950 aa  204  9e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  37.27 
 
 		 1534 aa  204  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.87 
 
 		 1795 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  35.96 
 
 		 1532 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  47.23 
 
 		 3427 aa  199  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  47.37 
 
 		 2105 aa  196  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  40.36 
 
 		 595 aa  196  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  44.37 
 
 		 1164 aa  183  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  44.01 
 
 		 833 aa  183  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  40.78 
 
 		 4334 aa  182  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  39.36 
 
 		 1363 aa  181  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  36.6 
 
 		 2689 aa  181  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  41.85 
 
 		 613 aa  178  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  39.17 
 
 		 9867 aa  178  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  43.16 
 
 		 526 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  30.87 
 
 		 792 aa  174  6.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  43.81 
 
 		 1424 aa  174  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  43.28 
 
 		 980 aa  172  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  37.69 
 
 		 3954 aa  171  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  38.72 
 
 		 965 aa  170  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  41.29 
 
 		 387 aa  170  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  44.48 
 
 		 2667 aa  170  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  32.81 
 
 		 1895 aa  169  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  35.31 
 
 		 3619 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  40.25 
 
 		 1287 aa  166  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  49.12 
 
 		 491 aa  166  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  35.08 
 
 		 3619 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  36.76 
 
 		 824 aa  162  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  33.58 
 
 		 2911 aa  160  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  35.59 
 
 		 1462 aa  160  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  43.69 
 
 		 393 aa  159  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  32.01 
 
 		 833 aa  158  7e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  38.32 
 
 		 4687 aa  157  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  37.72 
 
 		 4800 aa  156  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  46.57 
 
 		 982 aa  155  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.49 
 
 		 2678 aa  155  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  45.12 
 
 		 387 aa  154  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  40.47 
 
 		 341 aa  154  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  45.88 
 
 		 363 aa  154  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  40.87 
 
 		 396 aa  150  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  34.77 
 
 		 3608 aa  150  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.24 
 
 		 2668 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  34.94 
 
 		 1855 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  42.44 
 
 		 850 aa  149  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  39.43 
 
 		 437 aa  147  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  42.86 
 
 		 2145 aa  147  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  35.91 
 
 		 795 aa  145  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.44 
 
 		 1236 aa  143  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  41.73 
 
 		 460 aa  142  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  32.82 
 
 		 2775 aa  142  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  32.64 
 
 		 556 aa  140  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  41.69 
 
 		 437 aa  139  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  32.21 
 
 		 1499 aa  138  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  44.19 
 
 		 518 aa  137  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  35.09 
 
 		 769 aa  135  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1574  hypothetical protein  40.7 
 
 		 207 aa  135  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.010056  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  33.4 
 
 		 860 aa  134  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2930  hypothetical protein  40.12 
 
 		 207 aa  133  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505078  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2108  hypothetical protein  39.7 
 
 		 353 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.19 
 
 		 588 aa  133  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  32.78 
 
 		 1079 aa  132  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  43.11 
 
 		 615 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0911  hypothetical protein  38.38 
 
 		 232 aa  132  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0645348 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  39 
 
 		 341 aa  129  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  31.55 
 
 		 1884 aa  128  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  32.73 
 
 		 1156 aa  128  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5076  hypothetical protein  39.77 
 
 		 736 aa  127  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  34.32 
 
 		 728 aa  127  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  44.88 
 
 		 757 aa  127  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  31.34 
 
 		 942 aa  126  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  39.07 
 
 		 742 aa  126  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  41.63 
 
 		 639 aa  125  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  33.4 
 
 		 589 aa  125  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  48.17 
 
 		 679 aa  123  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  34.59 
 
 		 1544 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  44.94 
 
 		 606 aa  122  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1287  VCBS  38.35 
 
 		 610 aa  122  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.535504  normal  0.448224 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  41.04 
 
 		 460 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  46.11 
 
 		 421 aa  122  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  35.35 
 
 		 4798 aa  121  7e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  40.77 
 
 		 813 aa  121  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.97 
 
 		 1963 aa  119  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0133  putative type I secretion target repeat protein  35.23 
 
 		 319 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1434  type I secretion target repeat-containing protein  37.62 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  48.63 
 
 		 1197 aa  120  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  46.95 
 
 		 582 aa  119  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.36 
 
 		 1415 aa  119  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0082  type I secretion target repeat-containing protein  43.78 
 
 		 355 aa  118  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  45.41 
 
 		 361 aa  118  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  45.41 
 
 		 361 aa  118  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  32.63 
 
 		 959 aa  117  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>