75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0133 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0133  putative type I secretion target repeat protein  100 
 
 		 319 aa  650    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0234  hypothetical protein  50.96 
 
 		 354 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0232  hypothetical protein  47.52 
 
 		 356 aa  189  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2108  hypothetical protein  48.42 
 
 		 353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  46.32 
 
 		 833 aa  153  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3000  hypothetical protein  43.23 
 
 		 526 aa  147  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  44.85 
 
 		 425 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0353  hypothetical protein  43.65 
 
 		 530 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1836  hypothetical protein  48.42 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1272  hypothetical protein  44.51 
 
 		 351 aa  142  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0807  hypothetical protein  47.93 
 
 		 342 aa  142  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3087  hypothetical protein  41.88 
 
 		 477 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  40.57 
 
 		 561 aa  136  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 		 589 aa  135  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  44.38 
 
 		 767 aa  135  9e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0911  hypothetical protein  40.2 
 
 		 232 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0645348 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1505  hypothetical protein  48.81 
 
 		 398 aa  129  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0183734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0953  hypothetical protein  36.47 
 
 		 364 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1434  type I secretion target repeat-containing protein  39.47 
 
 		 220 aa  125  8.000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1453  hypothetical protein  44.97 
 
 		 387 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2930  hypothetical protein  43.71 
 
 		 207 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505078  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  36.98 
 
 		 1043 aa  121  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1574  hypothetical protein  41.9 
 
 		 207 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.010056  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3159  hypothetical protein  31.06 
 
 		 322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  39.6 
 
 		 1462 aa  115  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  36.12 
 
 		 950 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0264  hypothetical protein  42.94 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1488  hemolysin-type calcium-binding region  38.69 
 
 		 854 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  36.42 
 
 		 792 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1206  hypothetical protein  32.27 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1763  hypothetical protein  42.36 
 
 		 516 aa  94.7  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.85755  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0663  hypothetical protein  38.62 
 
 		 1503 aa  94.7  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.994599  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0780  hypothetical protein  32.57 
 
 		 340 aa  94  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1987  hypothetical protein  38.62 
 
 		 499 aa  94.4  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1804  hypothetical protein  38.51 
 
 		 338 aa  93.6  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.269337  normal  0.0111784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4889  hypothetical protein  29.07 
 
 		 447 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0641  hypothetical protein  38.89 
 
 		 594 aa  90.9  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00375147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6773  hypothetical protein  40.85 
 
 		 308 aa  89  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  36.17 
 
 		 452 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1166  triple helix repeat-containing collagen  39.16 
 
 		 1050 aa  85.9  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000520628  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5397  hypothetical protein  34.01 
 
 		 465 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2933  hypothetical protein  32.56 
 
 		 469 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3516  hypothetical protein  39.73 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4881  Collagen triple helix repeat protein  37.32 
 
 		 743 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4724  collagen triple helix repeat  37.93 
 
 		 342 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.958299  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2062  hypothetical protein  29.3 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1179  hypothetical protein  37.06 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.983645  normal  0.0540579 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5071  triple helix repeat-containing collagen  35.21 
 
 		 465 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0278582  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2619  hypothetical protein  37.32 
 
 		 460 aa  80.1  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0605452  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5751  hypothetical protein  39.04 
 
 		 363 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4207  triple helix repeat-containing collagen  38.36 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.532408 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  37.06 
 
 		 641 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2113  hypothetical protein  35.42 
 
 		 493 aa  77  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  0.126619 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0421  hypothetical protein  34.69 
 
 		 738 aa  76.6  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3178  hypothetical protein  36.14 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2422  hypothetical protein  38.97 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.756462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0722  hypothetical protein  32.96 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0772  hypothetical protein  32.96 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.585439  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0616  hypothetical protein  29.63 
 
 		 255 aa  72.4  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3940  hypothetical protein  32.75 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3487  triple helix repeat-containing collagen  35.92 
 
 		 848 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4817  hypothetical protein  35.17 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.542662 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1563  hypothetical protein  30.82 
 
 		 230 aa  65.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.170983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0306  hypothetical protein  28.57 
 
 		 644 aa  59.3  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.919182  decreased coverage  0.00578351 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0352  hypothetical protein  31.64 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1283  hypothetical protein  50.88 
 
 		 190 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00921825  normal  0.841233 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2968  hypothetical protein  31.82 
 
 		 197 aa  51.6  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1786  hypothetical protein  32.26 
 
 		 236 aa  49.3  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.990579  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1025  hypothetical protein  27.41 
 
 		 182 aa  49.3  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2477  hypothetical protein  37.38 
 
 		 190 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.741736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6097  hypothetical protein  35.04 
 
 		 156 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1518  hypothetical protein  31.25 
 
 		 202 aa  47.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.785989  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1776  hypothetical protein  34.65 
 
 		 156 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2997  hypothetical protein  27.61 
 
 		 365 aa  44.3  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1097  hypothetical protein  45.16 
 
 		 208 aa  42.7  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.68714  decreased coverage  0.00547678 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>