71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1574 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1574  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.010056  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2930  hypothetical protein  97.09 
 
 		 207 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505078  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0911  hypothetical protein  80.51 
 
 		 232 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0645348 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1434  type I secretion target repeat-containing protein  58.47 
 
 		 220 aa  229  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  53.55 
 
 		 833 aa  211  7e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1836  hypothetical protein  48.09 
 
 		 369 aa  167  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  47.24 
 
 		 561 aa  165  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  45.11 
 
 		 1462 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0953  hypothetical protein  45.35 
 
 		 364 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1453  hypothetical protein  44.83 
 
 		 387 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2108  hypothetical protein  42.02 
 
 		 353 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  45.98 
 
 		 589 aa  138  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  45.58 
 
 		 792 aa  137  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  40.7 
 
 		 1043 aa  134  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0232  hypothetical protein  47.51 
 
 		 356 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  41.28 
 
 		 767 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0234  hypothetical protein  46.91 
 
 		 354 aa  132  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0353  hypothetical protein  37.63 
 
 		 530 aa  125  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  43.39 
 
 		 425 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1505  hypothetical protein  44.77 
 
 		 398 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0183734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3087  hypothetical protein  41.76 
 
 		 477 aa  119  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3159  hypothetical protein  39.15 
 
 		 322 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0133  putative type I secretion target repeat protein  42.13 
 
 		 319 aa  115  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  39.77 
 
 		 950 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3000  hypothetical protein  36.6 
 
 		 526 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1272  hypothetical protein  38.69 
 
 		 351 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0780  hypothetical protein  34.3 
 
 		 340 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0807  hypothetical protein  38.33 
 
 		 342 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4889  hypothetical protein  43.36 
 
 		 447 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5397  hypothetical protein  41.5 
 
 		 465 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1166  triple helix repeat-containing collagen  38.78 
 
 		 1050 aa  97.8  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000520628  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1488  hemolysin-type calcium-binding region  35.75 
 
 		 854 aa  98.2  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1179  hypothetical protein  39.73 
 
 		 343 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.983645  normal  0.0540579 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4207  triple helix repeat-containing collagen  41.26 
 
 		 346 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.532408 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3516  hypothetical protein  41.26 
 
 		 346 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5071  triple helix repeat-containing collagen  42.36 
 
 		 465 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0278582  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4724  collagen triple helix repeat  40.14 
 
 		 342 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.958299  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2933  hypothetical protein  34.38 
 
 		 469 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2062  hypothetical protein  36.41 
 
 		 418 aa  92  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4881  Collagen triple helix repeat protein  33.51 
 
 		 743 aa  92  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1987  hypothetical protein  34.25 
 
 		 499 aa  90.9  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  40.56 
 
 		 452 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2619  hypothetical protein  35.56 
 
 		 460 aa  89.7  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0605452  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5751  hypothetical protein  36.46 
 
 		 363 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0641  hypothetical protein  40.54 
 
 		 594 aa  88.6  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00375147  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0264  hypothetical protein  39.07 
 
 		 352 aa  87.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2968  hypothetical protein  35.85 
 
 		 197 aa  86.3  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3487  triple helix repeat-containing collagen  39.44 
 
 		 848 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1763  hypothetical protein  40.14 
 
 		 516 aa  84.3  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.85755  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6773  hypothetical protein  36.42 
 
 		 308 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1804  hypothetical protein  32.17 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.269337  normal  0.0111784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2422  hypothetical protein  36.5 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.756462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3940  hypothetical protein  29.94 
 
 		 273 aa  78.2  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0772  hypothetical protein  31.32 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.585439  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0722  hypothetical protein  31.32 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2113  hypothetical protein  32.41 
 
 		 493 aa  72.8  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  0.126619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  36.42 
 
 		 641 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1206  hypothetical protein  31.76 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3178  hypothetical protein  30.11 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1563  hypothetical protein  30.64 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.170983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0421  hypothetical protein  35.04 
 
 		 738 aa  63.2  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0663  hypothetical protein  34.59 
 
 		 1503 aa  61.6  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.994599  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0306  hypothetical protein  27.37 
 
 		 644 aa  55.5  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.919182  decreased coverage  0.00578351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1283  hypothetical protein  45 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00921825  normal  0.841233 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0616  hypothetical protein  26.16 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1159  hypothetical protein  29.5 
 
 		 172 aa  52.4  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4817  hypothetical protein  26.9 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.542662 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2477  hypothetical protein  35.85 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.741736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1097  hypothetical protein  31.85 
 
 		 208 aa  48.5  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.68714  decreased coverage  0.00547678 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1518  hypothetical protein  29.2 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.785989  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1025  hypothetical protein  26.52 
 
 		 182 aa  45.4  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>