More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1606 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  456  1e-127  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  46.92 
 
 		 212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0337  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4031  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 203 aa  101  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25680  transcriptional regulator  31.09 
 
 		 203 aa  99.4  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2627  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  98.6  7e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108473  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  27.4 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  26.96 
 
 		 207 aa  91.7  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0820  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 219 aa  85.5  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0110693  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  39.84 
 
 		 197 aa  84.7  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  25.98 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1939  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.640559  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0312  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.041978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  31.72 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03670  transcriptional regulator  23.56 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00912022  hitchhiker  0.0085588 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3518  regulatory protein, TetR  43.14 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640434  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4830  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2005  hypothetical protein  26.11 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0591138  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.42 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  39.62 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 332 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 324 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 183 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0246  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330264  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4541  regulatory protein, TetR  37.31 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0842313  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 228 aa  53.1  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5376  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 445 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  47.06 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 219 aa  52.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.06 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.06 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.06 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.06 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.06 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3194  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 188 aa  52.4  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  47.06 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.06 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 221 aa  52  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 200 aa  52  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 200 aa  52  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 205 aa  51.6  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.1 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2337  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 199 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784236 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.1 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.1 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.1 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 245 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4681  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.1 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  41.51 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2732  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0298  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1766  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390977  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5097  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>