More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0513 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1446  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.66 
 
 
811 aa  749    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1727  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  56.83 
 
 
793 aa  800    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0513  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
803 aa  1607    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.883754  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.94 
 
 
840 aa  495  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  47.19 
 
 
945 aa  425  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  46.25 
 
 
892 aa  422  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  46.99 
 
 
945 aa  421  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  41.63 
 
 
766 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  45.66 
 
 
866 aa  421  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1983  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.36 
 
 
847 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.138459 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.63 
 
 
770 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.51 
 
 
880 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.89 
 
 
874 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
853 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2124  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.83 
 
 
857 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104313  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.87 
 
 
857 aa  411  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1984  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.54 
 
 
752 aa  410  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.34 
 
 
853 aa  412  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  45.51 
 
 
888 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2632  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.01 
 
 
906 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2375  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.45 
 
 
766 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3527  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.67 
 
 
839 aa  405  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.064663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2602  PAS sensor protein  41.41 
 
 
903 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.41 
 
 
903 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198382 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1929  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  47.93 
 
 
853 aa  400  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2229  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.74 
 
 
925 aa  399  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.843602  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2820  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  47.2 
 
 
829 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1700  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 
850 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.99866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5149  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.53 
 
 
869 aa  392  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1525  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.28 
 
 
872 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40409  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.03 
 
 
890 aa  388  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.86 
 
 
867 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.126106 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1228  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.88 
 
 
769 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0595  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.53 
 
 
680 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0319  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  38.88 
 
 
824 aa  382  1e-104  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.655044  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0755  sensor histidine kinase/response regulator  39.27 
 
 
828 aa  379  1e-103  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.14 
 
 
867 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00129243  normal  0.0294734 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0853  sensor histidine kinase/reponse regulator  30.82 
 
 
845 aa  379  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00134282  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2463  two component sensor kinase  48.66 
 
 
872 aa  375  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.899501  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1644  histidine kinase  49.88 
 
 
779 aa  372  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000228151 
 
 
-
 
NC_002978  WD1216  sensor histidine kinase/response regulator  44.23 
 
 
417 aa  366  1e-100  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.16 
 
 
639 aa  333  8e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1385  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.55 
 
 
695 aa  329  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.9 
 
 
1132 aa  326  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.97 
 
 
557 aa  320  6e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  39.88 
 
 
1112 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  38.76 
 
 
1561 aa  308  2.0000000000000002e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  44.13 
 
 
749 aa  307  6e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.38 
 
 
1260 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.69 
 
 
753 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 
859 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.42 
 
 
853 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 
845 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.35 
 
 
1134 aa  303  7.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  39.51 
 
 
733 aa  303  9e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.59 
 
 
962 aa  301  3e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.28 
 
 
650 aa  300  5e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.94 
 
 
752 aa  300  5e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.52 
 
 
845 aa  300  7e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.18 
 
 
769 aa  300  8e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.87 
 
 
1260 aa  299  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.59 
 
 
766 aa  300  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0666  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.87 
 
 
831 aa  297  6e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1654  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.49 
 
 
1115 aa  296  1e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0520  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 
751 aa  295  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 
522 aa  295  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  36.61 
 
 
1015 aa  294  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  42.36 
 
 
824 aa  294  6e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2685  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.72 
 
 
660 aa  293  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41147  normal  0.190122 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.43 
 
 
661 aa  292  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 
1106 aa  291  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  43 
 
 
527 aa  291  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.62 
 
 
1176 aa  291  5.0000000000000004e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.25 
 
 
828 aa  289  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00791305  hitchhiker  0.0012729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 
773 aa  288  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.29 
 
 
864 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.34 
 
 
796 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  43.89 
 
 
573 aa  287  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.73 
 
 
1079 aa  286  7e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 
1102 aa  286  7e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.82 
 
 
796 aa  287  7e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.39 
 
 
548 aa  286  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.34 
 
 
926 aa  286  9e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6438  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.09 
 
 
668 aa  286  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160303  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1154  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.21 
 
 
925 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.55 
 
 
953 aa  284  5.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 
773 aa  283  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.63 
 
 
657 aa  281  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0366  sensor histidine kinase/response regulator  38.73 
 
 
742 aa  281  4e-74  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.69 
 
 
643 aa  281  5e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.41 
 
 
849 aa  281  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.61 
 
 
1180 aa  281  5e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.85 
 
 
645 aa  280  9e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.62 
 
 
922 aa  279  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 
819 aa  279  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.82 
 
 
551 aa  279  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4726  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.22 
 
 
625 aa  278  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140851  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 
1322 aa  277  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.78 
 
 
822 aa  277  6e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.76 
 
 
777 aa  276  8e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>