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for query gene Sros_8507 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 199 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  77.6 
 
 		 222 aa  280  7.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4496  TetR family transcriptional regulator  68.37 
 
 		 199 aa  223  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4583  TetR family transcriptional regulator  68.37 
 
 		 199 aa  223  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4879  TetR family transcriptional regulator  68.37 
 
 		 199 aa  223  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1492  TetR family transcriptional regulator  65.78 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  45.92 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 217 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  41.71 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  41.5 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  40.72 
 
 		 223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 211 aa  113  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 213 aa  111  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 266 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  41.58 
 
 		 213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  33.5 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  39.11 
 
 		 228 aa  106  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 216 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  39.79 
 
 		 299 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 245 aa  101  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  36.6 
 
 		 222 aa  101  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 188 aa  101  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 236 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  36.96 
 
 		 237 aa  96.7  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 259 aa  95.5  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  40.11 
 
 		 186 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  39.56 
 
 		 190 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  41.14 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 194 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 194 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 194 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 201 aa  88.6  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 223 aa  88.6  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 184 aa  88.6  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1574  TetR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 195 aa  88.2  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  34.72 
 
 		 223 aa  85.9  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  37.02 
 
 		 195 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  34.54 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0331  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  32.5 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  35.57 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  52.87 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  37.09 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 204 aa  77.8  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  34.25 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  34.05 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  30.81 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
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NC_013510  Tcur_1510  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116924  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  41.96 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  35.94 
 
 		 195 aa  72  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
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NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 193 aa  72  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
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NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_2057  putative transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.891873 
 
 
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NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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