More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2940 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 1196 aa  2447    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.22 
 
 		 1203 aa  611  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3661  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits  27.77 
 
 		 1035 aa  216  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  35.47 
 
 		 946 aa  160  9e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  26.13 
 
 		 903 aa  145  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  25.91 
 
 		 925 aa  144  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  24.68 
 
 		 906 aa  135  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0693  superfamily protein I DNA/RNA helicase  29.75 
 
 		 934 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  24.11 
 
 		 922 aa  118  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  25.65 
 
 		 928 aa  115  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  22.62 
 
 		 932 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  33.64 
 
 		 925 aa  113  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  23.2 
 
 		 907 aa  111  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  23.88 
 
 		 914 aa  110  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  23.01 
 
 		 1121 aa  111  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  23.39 
 
 		 758 aa  107  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  24.65 
 
 		 900 aa  105  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  23.24 
 
 		 905 aa  105  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0774  ATP-binding protein  23.57 
 
 		 904 aa  105  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00601607  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  23.44 
 
 		 916 aa  104  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00472  hypothetical protein  26.3 
 
 		 1049 aa  102  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0358017  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  30.87 
 
 		 1490 aa  100  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5224  DNA helicase related protein  31.73 
 
 		 1056 aa  100  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0661737  normal  0.788019 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1440  RAP domain protein  21.46 
 
 		 1081 aa  98.6  6e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.112962  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  34.45 
 
 		 1557 aa  97.1  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  27.54 
 
 		 908 aa  97.1  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.68 
 
 		 445 aa  96.3  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2433  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.68 
 
 		 445 aa  96.3  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  25.77 
 
 		 1002 aa  96.3  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6959  DNA helicase related protein  32.26 
 
 		 1157 aa  95.9  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.181684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  32.04 
 
 		 1185 aa  95.9  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1254  DNA helicase related protein  30.6 
 
 		 1094 aa  94.7  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3984  DNA helicase related protein  30 
 
 		 1087 aa  92.8  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  28.62 
 
 		 1132 aa  92.4  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1238  phospholipase D/transphosphatidylase  29.07 
 
 		 1178 aa  92.4  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.927717  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  26.93 
 
 		 975 aa  91.3  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  28.23 
 
 		 958 aa  91.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1979  phospholipase D/transphosphatidylase  29.23 
 
 		 1178 aa  90.1  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1989  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  26.73 
 
 		 605 aa  89.4  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0620689  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  21.47 
 
 		 650 aa  89.7  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  26.3 
 
 		 1099 aa  89.7  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.57 
 
 		 1557 aa  89.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2785  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.89 
 
 		 1477 aa  89  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.464639 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  26.67 
 
 		 1790 aa  88.2  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  27.12 
 
 		 1474 aa  87.4  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  29.61 
 
 		 1523 aa  87  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  26.32 
 
 		 1622 aa  86.7  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  21.43 
 
 		 650 aa  85.9  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3025  hypothetical protein  30.14 
 
 		 1176 aa  85.5  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0376122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  28.77 
 
 		 606 aa  85.5  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  27.38 
 
 		 611 aa  85.1  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  26.97 
 
 		 905 aa  84.7  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3992  hypothetical protein  28.33 
 
 		 1126 aa  84.7  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.78 
 
 		 1240 aa  84.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1760  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1220 aa  84.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  26.97 
 
 		 905 aa  84.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  29.68 
 
 		 754 aa  83.2  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.76 
 
 		 1686 aa  82.8  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  29.15 
 
 		 1041 aa  82.4  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1724 aa  82  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  26.51 
 
 		 905 aa  82  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1560  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.12 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5307  KAP P-loop domain-containing protein  31.93 
 
 		 770 aa  82  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  29.93 
 
 		 587 aa  81.6  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 1760 aa  81.6  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  29.62 
 
 		 619 aa  81.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  26.74 
 
 		 1630 aa  81.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4746  superfamily I DNA helicase  25.95 
 
 		 1171 aa  80.9  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140962 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4451  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30 
 
 		 795 aa  80.9  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  26.28 
 
 		 905 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4542  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30 
 
 		 795 aa  80.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  29.27 
 
 		 622 aa  80.1  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0055  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.61 
 
 		 316 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000868193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  28.92 
 
 		 622 aa  78.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  29.33 
 
 		 2245 aa  78.6  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  29.43 
 
 		 902 aa  78.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25.82 
 
 		 1403 aa  78.2  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  27.13 
 
 		 748 aa  78.2  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  30.86 
 
 		 651 aa  77.4  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  26.57 
 
 		 1062 aa  77.8  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4016  hypothetical protein  26.99 
 
 		 1100 aa  77  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  23.91 
 
 		 914 aa  77  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1514  phospholipase D/transphosphatidylase  28.47 
 
 		 1190 aa  77.4  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884215  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  27.24 
 
 		 633 aa  76.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  28.1 
 
 		 442 aa  76.3  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1652 aa  76.3  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1784  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.78 
 
 		 1164 aa  76.6  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0724834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4321  hypothetical protein  28.08 
 
 		 1126 aa  75.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1889  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1092 aa  75.9  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  27.38 
 
 		 629 aa  75.9  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  25.91 
 
 		 636 aa  75.9  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  27.21 
 
 		 1328 aa  75.5  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  23 
 
 		 1653 aa  75.5  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  28.37 
 
 		 1189 aa  75.5  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  26.52 
 
 		 633 aa  75.5  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  25.67 
 
 		 1803 aa  75.1  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  29.97 
 
 		 1697 aa  75.1  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  28.69 
 
 		 2123 aa  75.1  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  24.49 
 
 		 1296 aa  75.1  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  25.36 
 
 		 2045 aa  75.1  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>