282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14760 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_14760  universal stress protein UspA-like protein  100 
 
 		 160 aa  318  1.9999999999999998e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0107987 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2020  UspA domain protein  39.38 
 
 		 165 aa  107  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000426305 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01240  universal stress protein UspA-like protein  40.37 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03760  universal stress protein UspA-like protein  38.51 
 
 		 154 aa  84.7  5e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00361063  normal  0.318246 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16290  universal stress protein UspA-like protein  33.74 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000127865  hitchhiker  0.0000372029 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3008  UspA domain protein  30.63 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.396305 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  35.58 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  35.98 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  33.54 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  34.76 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  32.28 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  39.1 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  34.38 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  32.12 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  33.93 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  35.44 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  33.33 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  33.95 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  32.72 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  32.73 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  31.93 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  30.25 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  31.68 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  29.75 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  30.95 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  28.93 
 
 		 208 aa  57  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  36.77 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  27.11 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  31.25 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  34.16 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  32.12 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0646  UspA domain-containing protein  32.08 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  28.75 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  34.78 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  32.12 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  31.29 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  31.29 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  30.3 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  31.06 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  32.92 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  26.92 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  32.12 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  32.12 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  32.12 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  32.12 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  32.12 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  32.12 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  32.12 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0515  universal stress protein  31.68 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0014722  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  33.95 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  30.54 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  30.54 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  32.72 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  32.73 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  28.22 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  29.88 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  29.63 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.56 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  31.87 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0923  UspA domain protein  30.57 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.840316  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2814  UspA domain protein  30.63 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000545655  hitchhiker  0.00186691 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  31.74 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  30.82 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  27.5 
 
 		 207 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  31.1 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  32.3 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  33.54 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  30 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  27.04 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  31.65 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  30.49 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  29.38 
 
 		 152 aa  52  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  30.25 
 
 		 144 aa  51.6  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  31.45 
 
 		 144 aa  51.6  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.71 
 
 		 158 aa  51.6  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  30.54 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2210  universal stress protein UspA  32.34 
 
 		 149 aa  51.2  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  31.52 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  30.57 
 
 		 136 aa  51.2  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3418  UspA domain protein  30.38 
 
 		 133 aa  51.2  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  33.12 
 
 		 290 aa  51.2  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  30.13 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  31.52 
 
 		 307 aa  50.8  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  30.3 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  29.19 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  31.1 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  29.76 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  30.25 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  27.71 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  29.89 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  31.71 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  31.25 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  33.13 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  28.4 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>