93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1704 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  100 
 
 		 543 aa  1089    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  64.18 
 
 		 846 aa  488  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  65.71 
 
 		 846 aa  486  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  69.16 
 
 		 846 aa  478  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  68.22 
 
 		 848 aa  474  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  36.6 
 
 		 680 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  42.55 
 
 		 360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  42.55 
 
 		 360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  42.55 
 
 		 360 aa  221  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  37.46 
 
 		 510 aa  220  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  42.24 
 
 		 360 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  42.72 
 
 		 360 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  42.41 
 
 		 360 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  34.23 
 
 		 551 aa  213  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  42.86 
 
 		 360 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  42.41 
 
 		 360 aa  209  7e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  41.8 
 
 		 360 aa  209  7e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  37.61 
 
 		 376 aa  209  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  36.09 
 
 		 1362 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  33.15 
 
 		 648 aa  190  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  35.48 
 
 		 420 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  36.42 
 
 		 468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  33.73 
 
 		 1578 aa  176  9e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  32.62 
 
 		 341 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  33.33 
 
 		 613 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  37.54 
 
 		 467 aa  169  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  35.43 
 
 		 460 aa  157  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  30.1 
 
 		 565 aa  123  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  29.26 
 
 		 729 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  29.26 
 
 		 729 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  27.67 
 
 		 492 aa  116  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  27.76 
 
 		 699 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  27.3 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  27.92 
 
 		 471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3736  chitinase D  42.44 
 
 		 174 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61469e-18 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  26.88 
 
 		 484 aa  107  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  27.73 
 
 		 598 aa  107  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  31.79 
 
 		 516 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  26.84 
 
 		 727 aa  103  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3735  extracellular exochitinase Chi36  45.97 
 
 		 189 aa  103  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.72466e-18 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  33.2 
 
 		 551 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  26.98 
 
 		 803 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  24.5 
 
 		 483 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  24.57 
 
 		 483 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3568  glycosyl hydrolase family chitinase  24.85 
 
 		 353 aa  93.6  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4407  hypothetical protein  39.33 
 
 		 245 aa  91.7  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1121  hypothetical protein  27.95 
 
 		 782 aa  89.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1117  hypothetical protein  28.53 
 
 		 782 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  32.38 
 
 		 1051 aa  73.9  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  40.45 
 
 		 540 aa  72  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl347  chitinase  26.28 
 
 		 1113 aa  69.7  0.0000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135445  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  52.94 
 
 		 792 aa  69.7  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  36.96 
 
 		 1053 aa  67  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  29.63 
 
 		 1054 aa  65.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05607  hypothetical protein  32.32 
 
 		 962 aa  62.4  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  29.66 
 
 		 816 aa  58.2  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68871  chitinase 3 precursor  28.24 
 
 		 437 aa  55.8  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.688997  normal  0.0498735 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.28 
 
 		 699 aa  55.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  34.33 
 
 		 634 aa  53.9  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  52.27 
 
 		 848 aa  53.5  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  37.88 
 
 		 1113 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  50 
 
 		 855 aa  52  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  50 
 
 		 972 aa  52  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3182  hypothetical protein  24.18 
 
 		 334 aa  50.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000313674  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  32.14 
 
 		 1127 aa  50.8  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1459  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  51.28 
 
 		 261 aa  50.8  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0201  chitinase like protein  36.84 
 
 		 1204 aa  50.8  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  32.14 
 
 		 1127 aa  50.4  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  45.61 
 
 		 848 aa  50.4  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  32.14 
 
 		 1127 aa  50.4  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  19.14 
 
 		 521 aa  50.4  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5553  Chitinase  28.57 
 
 		 709 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.122706 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  31.3 
 
 		 1057 aa  49.7  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 		 1127 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  44.44 
 
 		 623 aa  48.5  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  42.55 
 
 		 426 aa  48.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  38.3 
 
 		 772 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  34.85 
 
 		 1129 aa  46.2  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  55.26 
 
 		 451 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  52.63 
 
 		 451 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  45.24 
 
 		 402 aa  45.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  55.26 
 
 		 451 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  50 
 
 		 353 aa  45.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  44.9 
 
 		 393 aa  45.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  47.62 
 
 		 1577 aa  44.7  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  52.63 
 
 		 451 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  52.63 
 
 		 451 aa  44.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  42 
 
 		 405 aa  44.3  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3389  Heparinase II/III family protein  45 
 
 		 1260 aa  44.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  52.63 
 
 		 451 aa  44.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  45.45 
 
 		 504 aa  44.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5624  Chitinase  47.5 
 
 		 421 aa  43.5  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.72 
 
 		 669 aa  43.5  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.637714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>