244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4418 on replicon NC_009036
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  100 
 
 		 213 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  43.4 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  39.91 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  35.83 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  35.83 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  34.91 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  35.83 
 
 		 233 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  33.84 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  34.76 
 
 		 240 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  33.48 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  33.9 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  32.91 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  32.16 
 
 		 229 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  32.92 
 
 		 243 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  31.36 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  31.66 
 
 		 259 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  32.2 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  32.64 
 
 		 230 aa  99.8  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  28.63 
 
 		 244 aa  94.7  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  28.63 
 
 		 244 aa  92.4  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  29.17 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  29.17 
 
 		 256 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  30.77 
 
 		 225 aa  88.2  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  27.27 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  25.24 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  26.29 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  32.85 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  22.86 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  35.11 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  27.43 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  28.57 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  24.46 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  33.11 
 
 		 248 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  0.0000000001929 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  28.83 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  33.57 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  22.22 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  23.83 
 
 		 264 aa  68.2  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  24.17 
 
 		 264 aa  68.2  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  29.45 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  29.32 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  23.5 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  32.17 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  24.12 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  24.86 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  24.21 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  22.49 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  26.15 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  27.89 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  23.47 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  26.73 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  30.77 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  24.75 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  25.93 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  29.28 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  24.17 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  25.85 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  32.58 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  27.98 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  27.98 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  27.98 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  25.46 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1366  putative prophage repressor  27.19 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.291481  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0077  phage repressor like transcriptional regulator  28.76 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08220  DNA-binding protein RDGA  25.36 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  23.67 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  37.88 
 
 		 394 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0155  helix-turn-helix domain-containing protein  38.16 
 
 		 135 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  24.15 
 
 		 196 aa  51.6  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  24.15 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 118 aa  51.2  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3177  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0647326  normal  0.0138701 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3290  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 67 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0230  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 137 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737224  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  25.42 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  29.32 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  23.81 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  27.95 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  22.98 
 
 		 265 aa  50.1  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  38.96 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  26.61 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  25.35 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 113 aa  49.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4795  transcriptional regulator, XRE family  38.75 
 
 		 134 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0939257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 196 aa  49.3  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  27.73 
 
 		 236 aa  49.3  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1183  putative prophage repressor  26.26 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355534  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2321  putative phage repressor  25.5 
 
 		 243 aa  48.5  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  40.85 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  42.86 
 
 		 131 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000218001  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  25.6 
 
 		 225 aa  48.5  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  28.06 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1815  XRE family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 137 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0843474  normal  0.166838 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5225  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 140 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0551  transcriptional regulator, XRE family  24.76 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.401249  hitchhiker  0.0000933135 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1039  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 264 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000101655  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  23.57 
 
 		 261 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2157  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.98 
 
 		 136 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>