86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1617 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  78.46 
 
 		 466 aa  707    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  100 
 
 		 505 aa  983    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  49.2 
 
 		 454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  51.65 
 
 		 467 aa  402  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  48.53 
 
 		 465 aa  383  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  48.92 
 
 		 464 aa  377  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  46.76 
 
 		 454 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  49.32 
 
 		 465 aa  372  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  46.89 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  47.37 
 
 		 450 aa  365  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  49.22 
 
 		 462 aa  363  4e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  48.64 
 
 		 489 aa  363  5.0000000000000005e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  49.41 
 
 		 479 aa  360  2e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  47.25 
 
 		 459 aa  359  8e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  48.24 
 
 		 455 aa  350  4e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  45.22 
 
 		 460 aa  349  5e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  47.66 
 
 		 461 aa  346  6e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  47.55 
 
 		 464 aa  344  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  46.67 
 
 		 493 aa  342  7e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  45.88 
 
 		 454 aa  342  8e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  47.08 
 
 		 452 aa  341  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  44.59 
 
 		 468 aa  341  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  44.57 
 
 		 464 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  46.85 
 
 		 457 aa  336  7e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  53.55 
 
 		 361 aa  336  7e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  47.19 
 
 		 435 aa  334  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  45.03 
 
 		 477 aa  331  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  48.86 
 
 		 441 aa  327  3e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  45.54 
 
 		 462 aa  325  9e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  44.16 
 
 		 464 aa  323  6e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  48.06 
 
 		 557 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  43.53 
 
 		 461 aa  319  6e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  52.88 
 
 		 435 aa  319  6e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  53.42 
 
 		 415 aa  317  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  45.83 
 
 		 476 aa  317  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  47.87 
 
 		 457 aa  317  4e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  46.08 
 
 		 478 aa  317  4e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  51.32 
 
 		 439 aa  315  9e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  51.13 
 
 		 432 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  45.8 
 
 		 473 aa  313  5.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  44.49 
 
 		 462 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  55.41 
 
 		 496 aa  295  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  51.35 
 
 		 446 aa  290  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  43.75 
 
 		 448 aa  289  9e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  44.2 
 
 		 466 aa  274  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  41.46 
 
 		 433 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  40.21 
 
 		 509 aa  169  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  35.86 
 
 		 483 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  38.76 
 
 		 476 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  35.91 
 
 		 523 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  35.35 
 
 		 481 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  34.76 
 
 		 532 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  36.59 
 
 		 477 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  33.5 
 
 		 483 aa  143  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  33.49 
 
 		 477 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  37.44 
 
 		 501 aa  139  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  45.08 
 
 		 840 aa  91.3  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  33.57 
 
 		 673 aa  87.4  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  34.29 
 
 		 2160 aa  76.3  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  42.34 
 
 		 168 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  28.73 
 
 		 575 aa  70.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  33.33 
 
 		 541 aa  67.8  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  28.76 
 
 		 593 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  31.17 
 
 		 523 aa  63.5  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  36.77 
 
 		 362 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  29.72 
 
 		 884 aa  58.9  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  28.88 
 
 		 759 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  25.93 
 
 		 530 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  28.99 
 
 		 767 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  36.23 
 
 		 717 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  37.93 
 
 		 1037 aa  53.5  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  30.09 
 
 		 1296 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  27.36 
 
 		 575 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  26.06 
 
 		 863 aa  48.5  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3328  polymorphic outer membrane protein  34.18 
 
 		 272 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000184033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  34.23 
 
 		 913 aa  47.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1920  hypothetical protein  36 
 
 		 417 aa  47  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.409778 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0765  hypothetical protein  38.28 
 
 		 294 aa  47  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  27.75 
 
 		 852 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  26.69 
 
 		 591 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  30.82 
 
 		 350 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  28.89 
 
 		 1332 aa  44.3  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  28.57 
 
 		 558 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  31.73 
 
 		 1755 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  31.11 
 
 		 1263 aa  43.5  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_54658  predicted protein  37.88 
 
 		 422 aa  43.5  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000768502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>