More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2417 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 823 aa  1649    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  39.84 
 
 		 856 aa  582  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  40.89 
 
 		 877 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  41.43 
 
 		 867 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  39.03 
 
 		 1015 aa  562  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  38.56 
 
 		 851 aa  551  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  37.84 
 
 		 867 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  38.51 
 
 		 869 aa  543  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  37.72 
 
 		 858 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 857 aa  536  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  37.41 
 
 		 861 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  37.84 
 
 		 870 aa  533  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  37.95 
 
 		 872 aa  534  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 867 aa  535  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  37.53 
 
 		 868 aa  528  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  39.17 
 
 		 864 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  39.8 
 
 		 800 aa  493  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  36.59 
 
 		 800 aa  445  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  37.01 
 
 		 800 aa  439  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  35.44 
 
 		 795 aa  413  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  35.85 
 
 		 795 aa  414  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  34.9 
 
 		 817 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  34.66 
 
 		 843 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  35.34 
 
 		 784 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  33.94 
 
 		 840 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  35.17 
 
 		 853 aa  402  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  34.04 
 
 		 803 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  34.96 
 
 		 797 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  34.96 
 
 		 797 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  35.08 
 
 		 797 aa  399  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  34.62 
 
 		 793 aa  396  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  34.26 
 
 		 793 aa  392  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  34.34 
 
 		 788 aa  387  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 797 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  35.05 
 
 		 961 aa  388  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  34.34 
 
 		 788 aa  389  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  34.57 
 
 		 812 aa  385  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  34.45 
 
 		 812 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  35.98 
 
 		 799 aa  384  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  34.57 
 
 		 812 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  34.5 
 
 		 797 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  33.22 
 
 		 847 aa  375  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  31.95 
 
 		 918 aa  371  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  34.38 
 
 		 835 aa  368  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  33.96 
 
 		 848 aa  365  2e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 811 aa  363  9e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  33.54 
 
 		 803 aa  359  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  32.67 
 
 		 933 aa  359  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  33.91 
 
 		 811 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.64 
 
 		 811 aa  357  5.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  33.46 
 
 		 884 aa  353  5e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  32.36 
 
 		 817 aa  350  7e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  32.86 
 
 		 871 aa  343  8e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  33.25 
 
 		 804 aa  341  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  31.81 
 
 		 883 aa  342  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 815 aa  336  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  31.57 
 
 		 874 aa  332  2e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 887 aa  330  5.0000000000000004e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  32.92 
 
 		 847 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  33.21 
 
 		 795 aa  327  6e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  30.1 
 
 		 870 aa  321  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.78 
 
 		 832 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 		 924 aa  320  5e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 853 aa  314  4.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  33.7 
 
 		 842 aa  314  5.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 815 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  31.2 
 
 		 818 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 947 aa  301  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 948 aa  299  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  30.79 
 
 		 821 aa  299  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  29.65 
 
 		 842 aa  296  9e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  32.12 
 
 		 924 aa  293  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 		 885 aa  293  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  30.03 
 
 		 833 aa  288  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 813 aa  276  8e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 		 816 aa  266  8.999999999999999e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 850 aa  263  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 858 aa  260  8e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 987 aa  253  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 852 aa  244  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 849 aa  239  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 879 aa  230  8e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  25.58 
 
 		 873 aa  218  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  31.26 
 
 		 948 aa  212  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 897 aa  150  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 836 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 894 aa  140  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 907 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 901 aa  128  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 853 aa  125  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 924 aa  125  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  26.21 
 
 		 853 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  25.72 
 
 		 853 aa  124  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 907 aa  124  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 869 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  26.08 
 
 		 853 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  26.08 
 
 		 853 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 867 aa  122  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 817 aa  120  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 867 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>