115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1556 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
486 aa  1004    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  62.89 
 
 
481 aa  615  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  51.43 
 
 
489 aa  514  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40 
 
 
502 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  42.04 
 
 
576 aa  177  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.91 
 
 
421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.74 
 
 
554 aa  173  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  37.34 
 
 
276 aa  169  8e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.32 
 
 
490 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  33.43 
 
 
971 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.24 
 
 
971 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  37.61 
 
 
499 aa  154  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.45 
 
 
649 aa  153  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.1 
 
 
485 aa  152  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.62 
 
 
860 aa  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  36.64 
 
 
477 aa  150  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2884  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.64 
 
 
1155 aa  149  8e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158927 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.48 
 
 
859 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  36.24 
 
 
486 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.5 
 
 
680 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.800014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.9 
 
 
495 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.05 
 
 
478 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.5 
 
 
515 aa  144  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1326  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.71 
 
 
728 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.11 
 
 
479 aa  141  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.63 
 
 
778 aa  140  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.12 
 
 
445 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  34.65 
 
 
449 aa  137  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.18 
 
 
485 aa  136  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.44 
 
 
839 aa  134  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.88 
 
 
629 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4852  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.02 
 
 
766 aa  132  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.771827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7623  hypothetical protein  34.51 
 
 
619 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0861286  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.2 
 
 
718 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.34 
 
 
1022 aa  126  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.79 
 
 
499 aa  124  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.77 
 
 
708 aa  125  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.85 
 
 
501 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.62 
 
 
713 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  33.03 
 
 
518 aa  124  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.02 
 
 
497 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.98 
 
 
504 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36 
 
 
472 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0611523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.18 
 
 
502 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0548  putative peptidase  32.16 
 
 
287 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  35.38 
 
 
500 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.19 
 
 
818 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3606  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.56 
 
 
292 aa  121  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.19 
 
 
784 aa  120  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.57 
 
 
1056 aa  119  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.75 
 
 
988 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  32.17 
 
 
527 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.75 
 
 
1056 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2207  hypothetical protein  32.33 
 
 
401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3036  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.14 
 
 
295 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.67 
 
 
528 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.43 
 
 
474 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.22 
 
 
541 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0752  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.48 
 
 
479 aa  114  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  37.67 
 
 
616 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  30 
 
 
523 aa  111  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0784  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.7 
 
 
291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.09 
 
 
522 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4626  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.3 
 
 
291 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4686  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.42 
 
 
289 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.88 
 
 
511 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0910  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.09 
 
 
553 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354692  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  32 
 
 
657 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3182  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.15 
 
 
1026 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740099  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  30.04 
 
 
535 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4521  caspase-like domain-containing protein  29.52 
 
 
798 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  31.5 
 
 
654 aa  100  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4069  caspase-1, p20  32.02 
 
 
482 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  29.65 
 
 
570 aa  99  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3731  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.63 
 
 
652 aa  94  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.016109  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.87 
 
 
397 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0861  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.37 
 
 
288 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1332  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.32 
 
 
824 aa  91.3  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0137  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.39 
 
 
915 aa  89.4  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.193132  normal  0.854443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0031  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.87 
 
 
442 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0940426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5502  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.35 
 
 
813 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0960  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.82 
 
 
862 aa  87.4  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.355322  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0290  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.25 
 
 
776 aa  87  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106858  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.72 
 
 
798 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  27.35 
 
 
472 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3269  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.51 
 
 
828 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336347  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  25.91 
 
 
925 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  26.83 
 
 
654 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  25.6 
 
 
781 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1053  GUN4 domain protein  27.36 
 
 
670 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0234472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  24.58 
 
 
636 aa  54.3  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.64 
 
 
477 aa  53.5  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0055  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.74 
 
 
316 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000868193  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.18 
 
 
658 aa  51.6  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0772  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.51 
 
 
902 aa  51.2  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1560  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.56 
 
 
316 aa  51.2  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2534  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.62 
 
 
941 aa  50.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.687385  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4451  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.86 
 
 
795 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.93 
 
 
324 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4542  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.86 
 
 
795 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>