More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01665 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  407  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  86.5 
 
 		 199 aa  329  2e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  42.39 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 180 aa  85.5  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 202 aa  85.1  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  32.67 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  29.38 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000584066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  35.81 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
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NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  36.02 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  29.87 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
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NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
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NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20619 
 
 
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NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
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NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
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NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.246546 
 
 
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NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  31.13 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
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NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
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NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  30.99 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  28.74 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
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NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  1 
 
 
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NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  32.91 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  32.91 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  31.93 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  32.91 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1527  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
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NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4824  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.870424 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_5889  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  30.77 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1567  TetR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.246189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 173 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 332 aa  52  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  36.09 
 
 		 191 aa  51.6  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  32.33 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4037  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0431559  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 307 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3310  hypothetical protein  26.58 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.106528 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
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NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 220 aa  48.9  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
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NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 181 aa  49.3  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
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NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
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NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 283 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_1022  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  37.33 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
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NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 223 aa  48.9  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
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NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  34.44 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
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