More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2924 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  474  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  69.2 
 
 		 239 aa  307  9e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0462  TetR family transcriptional regulator  69.86 
 
 		 239 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.573533  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  59.72 
 
 		 245 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5058  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3249  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 233 aa  111  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.87 
 
 		 236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.87 
 
 		 236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0946  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0854  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0914  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2999  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0882  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1287  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.03 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0967  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.34 
 
 		 224 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  31 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1794  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 229 aa  95.1  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152901  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00763  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.34 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.827218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2846  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2847  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.34 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0304787 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0850  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.34 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00780  hypothetical protein  32.34 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.978873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0861  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.34 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0944  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.34 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0819  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.34 
 
 		 223 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.852921 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2556  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.84 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  25.93 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3543  Transcriptional regulator TetR  33.5 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2883  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  0.331569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  27.51 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2069  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.620568  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0326  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  28.7 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  30.08 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  25.27 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4551  transcriptional regulator, N-terminus  50 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  37.66 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  30.96 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  25.13 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3581  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1118  regulatory protein TetR  26.75 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  44.44 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  31.54 
 
 		 233 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 205 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 209 aa  52.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1814  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 203 aa  52.4  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 414 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 227 aa  52  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 213 aa  52  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 423 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0794  transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4596  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 421 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.227831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>