More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5487 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  37.81 
 
 		 203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  37.64 
 
 		 186 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  50.94 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  45.33 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
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NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  41.8 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
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NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  44.78 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2064  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 233 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
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NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
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NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
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NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  47.06 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 263 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  40 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  46.3 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  35.06 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 258 aa  53.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 238 aa  52.8  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
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NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  38.33 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  38.33 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
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NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_3590  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
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NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  39.74 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  42.59 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1703  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 106 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 403 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 276 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  24.81 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 318 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 239 aa  49.3  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 272 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 318 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 273 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 316 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 318 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 317 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 273 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  39.47 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 273 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 316 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 318 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 316 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_2653  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
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NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
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