More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3687 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 189 aa  375  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  58.94 
 
 		 168 aa  177  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3695  transcriptional regulator, MarR family  65.13 
 
 		 162 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000171458  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  48.98 
 
 		 159 aa  138  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  44.64 
 
 		 178 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2643  MarR family transcriptional regulator  54.01 
 
 		 169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2688  MarR family transcriptional regulator  54.01 
 
 		 169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2672  MarR family transcriptional regulator  54.01 
 
 		 169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 178 aa  122  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 175 aa  105  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 176 aa  102  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  46.22 
 
 		 166 aa  98.6  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  37.67 
 
 		 176 aa  90.1  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 147 aa  88.2  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  36.92 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  30.91 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  37 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 		 177 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3861  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 141 aa  60.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.640191 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  35.35 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  41.33 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  28.04 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  39.34 
 
 		 157 aa  57.8  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  41.43 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0013  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1078  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  37.89 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 		 146 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 139 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 167 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  40.96 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1940  regulatory protein MarR  37.23 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.792334  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 172 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  33.01 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 		 157 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  38.04 
 
 		 138 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 153 aa  52.4  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 182 aa  52.4  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 152 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 152 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 152 aa  52  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 167 aa  52  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 156 aa  52  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 170 aa  52  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  27.27 
 
 		 283 aa  52  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 172 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 173 aa  51.6  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 172 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 172 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 152 aa  51.6  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 152 aa  51.6  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 152 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 152 aa  51.6  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06415  transcriptional regulator marR family protein  35.53 
 
 		 139 aa  51.6  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 152 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 152 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 163 aa  51.2  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 161 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  43.42 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1148  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 171 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  21.3 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  34.83 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  31.63 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 143 aa  50.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 143 aa  50.1  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 143 aa  50.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  37.33 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>