More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1893 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  420  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  89.81 
 
 		 206 aa  379  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  81.55 
 
 		 205 aa  313  8e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  81.55 
 
 		 205 aa  313  8e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  81.55 
 
 		 205 aa  313  8e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0954  transcriptional regulator, TetR family  37.07 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  37.06 
 
 		 199 aa  112  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 218 aa  111  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0406  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 212 aa  102  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10277  transcriptional regulator  30.1 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.133301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 207 aa  77.8  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  43.94 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  26.28 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  27.36 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 310 aa  54.7  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  50 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  32.12 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 250 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 307 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 309 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0963  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553529  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  58.7 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3937  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 234 aa  52.4  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2298  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5116  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 237 aa  52  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2195  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 189 aa  51.6  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 226 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 195 aa  51.6  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 199 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  28 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 216 aa  51.2  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 125 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  37.68 
 
 		 400 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 497 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>