199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1366 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1366  integrase family protein  100 
 
 		 447 aa  900    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.571831 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3323  integrase family protein  36.08 
 
 		 373 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  34.25 
 
 		 380 aa  209  9e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0882  phage integrase family protein  32.66 
 
 		 414 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.520245  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  30.18 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3077  integrase family protein  39.33 
 
 		 242 aa  118  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.486947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0524  integrase family protein  28.02 
 
 		 407 aa  103  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3189  phage integrase family protein  34.3 
 
 		 259 aa  93.6  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000104193  normal  0.041217 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  28.42 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  25 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  24.18 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  24.55 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  32.7 
 
 		 477 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25.36 
 
 		 414 aa  67  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  26.81 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  25.91 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  32.24 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  24.21 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  24.4 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  20.91 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  31.85 
 
 		 454 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  29.73 
 
 		 471 aa  63.2  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  30.72 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  25 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  24.14 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  26.43 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  28.19 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2011  integrase family protein  31.9 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1533  phage integrase family protein  25.97 
 
 		 304 aa  59.7  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.372982  normal  0.858007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  25.78 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  25.6 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  30.06 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  29.17 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  25.91 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1020  phage integrase family protein  25.73 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.085573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1039  phage integrase family protein  25.73 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.1908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4539  transposase B  28.22 
 
 		 637 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  28.02 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  23.51 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  21.84 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  30.38 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  25.99 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  29.52 
 
 		 371 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7037  hypothetical protein  24.77 
 
 		 387 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  27.16 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  24.85 
 
 		 356 aa  54.7  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  32.95 
 
 		 386 aa  55.1  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  24.5 
 
 		 451 aa  54.3  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  23.28 
 
 		 383 aa  54.3  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  24.6 
 
 		 401 aa  54.7  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  29.74 
 
 		 379 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  23.08 
 
 		 395 aa  53.9  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  29.74 
 
 		 379 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  26.54 
 
 		 416 aa  53.5  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1593  putative tyrosine recombinase XerD  28.03 
 
 		 184 aa  53.5  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.611626  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  30.97 
 
 		 367 aa  53.5  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2018  integrase family protein  31.29 
 
 		 452 aa  53.1  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  21.57 
 
 		 400 aa  53.1  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  22.93 
 
 		 378 aa  53.1  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  25.85 
 
 		 357 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  25.69 
 
 		 444 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  25.25 
 
 		 373 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  29.45 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  21.45 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  29.45 
 
 		 471 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0272  phage integrase  26.16 
 
 		 424 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0000104155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3678  integrase family protein  34.39 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  33.94 
 
 		 370 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0405  phage integrase family protein  27.82 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.629501  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  30.89 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  31.14 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  20.41 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  30 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  26.11 
 
 		 392 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1931  phage integrase family protein  31.48 
 
 		 218 aa  51.6  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0950556  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0304  phage integrase family protein  23.95 
 
 		 401 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0311  phage integrase family protein  23.95 
 
 		 401 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  32.49 
 
 		 387 aa  51.2  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3464  integrase family protein  30.29 
 
 		 377 aa  50.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5370  integrase family protein  26.25 
 
 		 498 aa  50.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  26.74 
 
 		 391 aa  50.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  28.65 
 
 		 412 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0607  integrase  25.61 
 
 		 374 aa  50.4  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1386  integrase family protein  24.72 
 
 		 344 aa  50.4  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.114707  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  26.18 
 
 		 412 aa  50.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.27 
 
 		 376 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.27 
 
 		 376 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1002  phage integrase  24.57 
 
 		 408 aa  50.1  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.606138  decreased coverage  0.00492215 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1690  integrase  24.19 
 
 		 348 aa  50.1  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  26.99 
 
 		 303 aa  50.1  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  26.13 
 
 		 404 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  26.34 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  41.67 
 
 		 399 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8918  integrase family protein  24.3 
 
 		 492 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0126697  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  29.19 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  29.73 
 
 		 393 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  30.25 
 
 		 451 aa  49.7  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  29.81 
 
 		 292 aa  49.7  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  26.18 
 
 		 422 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  19.52 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>